248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2659 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  100 
 
 		 526 aa  1034    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  57.71 
 
 		 551 aa  550  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  53.65 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  41.12 
 
 		 554 aa  356  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 		 547 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  41.73 
 
 		 514 aa  332  9e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 		 554 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 559 aa  329  9e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.5 
 
 		 510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  42.42 
 
 		 510 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  40.89 
 
 		 510 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  35.17 
 
 		 556 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 547 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 563 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 564 aa  215  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 561 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 565 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  34.63 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  34.63 
 
 		 532 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 		 536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 516 aa  173  5.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 532 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  31.15 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  30.37 
 
 		 527 aa  144  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 533 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 535 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 537 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.78 
 
 		 530 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 535 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 530 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 530 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 552 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.17 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.25 
 
 		 529 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.81 
 
 		 548 aa  123  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 531 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 520 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  28.13 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  27.39 
 
 		 531 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  29.74 
 
 		 535 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 536 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 523 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 534 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 520 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 524 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 524 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 519 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 533 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 474 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 534 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 532 aa  98.2  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.51 
 
 		 545 aa  97.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 481 aa  97.4  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  29.62 
 
 		 465 aa  97.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 560 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.93 
 
 		 511 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 474 aa  94.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.78 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  26.06 
 
 		 536 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  27.96 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 472 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 469 aa  87.8  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 515 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  29.64 
 
 		 508 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3148  amine oxidase  33.71 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0719859  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.91 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>