266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1744 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  90.64 
 
 
534 aa  903    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
534 aa  1033    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  59.92 
 
 
545 aa  586  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  57.43 
 
 
531 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  53.49 
 
 
530 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  59.24 
 
 
530 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  53.49 
 
 
530 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  53.49 
 
 
530 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  52.5 
 
 
560 aa  475  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  55.98 
 
 
580 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  48.91 
 
 
526 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  51.31 
 
 
528 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  48.02 
 
 
528 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  42.6 
 
 
524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 
506 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  38.61 
 
 
470 aa  273  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  37.45 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 
515 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 
474 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  40.32 
 
 
505 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  34.98 
 
 
465 aa  240  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 
469 aa  238  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  28.99 
 
 
476 aa  231  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  40.95 
 
 
474 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 
476 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 
481 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 
474 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 
478 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 
523 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 
472 aa  226  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
484 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  31.94 
 
 
476 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.67 
 
 
469 aa  225  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  39.04 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  35.76 
 
 
473 aa  220  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  41.15 
 
 
474 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 
466 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  38.4 
 
 
511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 
477 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
491 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
533 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
523 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 
468 aa  193  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.58 
 
 
503 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
554 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
487 aa  190  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
559 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 
554 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  32.88 
 
 
479 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  35.12 
 
 
477 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
564 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.85 
 
 
499 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
556 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
522 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  31.07 
 
 
535 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
547 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  32.03 
 
 
480 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  32.94 
 
 
476 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  32.94 
 
 
491 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  32.94 
 
 
491 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  32.75 
 
 
482 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  32.23 
 
 
482 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
524 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
565 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
563 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
528 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  32.6 
 
 
437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
531 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
561 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
510 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  32.48 
 
 
482 aa  163  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
491 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  30.8 
 
 
496 aa  160  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
555 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  26.86 
 
 
556 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 
536 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
547 aa  144  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.28 
 
 
527 aa  143  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.64 
 
 
510 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
514 aa  136  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  32.26 
 
 
532 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27.76 
 
 
529 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  32.26 
 
 
532 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
532 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.49 
 
 
530 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
523 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
533 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  29.24 
 
 
531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 
568 aa  127  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
534 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
531 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
531 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  32.65 
 
 
527 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.15 
 
 
533 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
539 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
537 aa  121  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>