187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4109 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
491 aa  989    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  46.56 
 
 
476 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  49.47 
 
 
470 aa  425  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  46.09 
 
 
484 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  47.46 
 
 
474 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  46.2 
 
 
474 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  45.38 
 
 
476 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  47.61 
 
 
479 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  51.46 
 
 
484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  45.47 
 
 
478 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 
477 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  47.02 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  45.03 
 
 
506 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  48.1 
 
 
482 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  46.68 
 
 
515 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  47.64 
 
 
487 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  41.15 
 
 
476 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  46.27 
 
 
466 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  45.74 
 
 
469 aa  364  2e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  44.67 
 
 
496 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.9 
 
 
499 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.33 
 
 
503 aa  355  7.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  43.04 
 
 
465 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  43.55 
 
 
473 aa  352  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 
487 aa  352  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  43.43 
 
 
472 aa  348  9e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  43.04 
 
 
480 aa  348  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  43.94 
 
 
491 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  43.94 
 
 
491 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  43.74 
 
 
476 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  42.04 
 
 
482 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  44.63 
 
 
491 aa  333  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 
468 aa  333  6e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  44.82 
 
 
505 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.27 
 
 
477 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
481 aa  315  9e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.07 
 
 
511 aa  312  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  45.44 
 
 
474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  40.61 
 
 
482 aa  306  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  44.8 
 
 
474 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 
524 aa  289  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  38.68 
 
 
469 aa  286  9e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  35.31 
 
 
545 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  46.74 
 
 
568 aa  226  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
560 aa  221  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 
534 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 
530 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  35.74 
 
 
437 aa  204  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 
534 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
528 aa  179  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  34.16 
 
 
530 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
526 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
528 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 
580 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
547 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
510 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.28 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
555 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  23.98 
 
 
556 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 
563 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
554 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
554 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 
565 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.07 
 
 
527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
531 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
523 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.63 
 
 
564 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
533 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
539 aa  110  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
549 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.79 
 
 
510 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
514 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
537 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 
528 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
547 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 
524 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
537 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
547 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
522 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  27.52 
 
 
533 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  26.31 
 
 
556 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
536 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
551 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
530 aa  94  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  28.36 
 
 
526 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 
535 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 
534 aa  90.9  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  28.36 
 
 
532 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  28.15 
 
 
510 aa  90.9  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  25.98 
 
 
529 aa  90.5  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  28.36 
 
 
532 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>