More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3174 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  99.06 
 
 
531 aa  1083    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  96.61 
 
 
531 aa  1012    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
531 aa  1090    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  51.42 
 
 
530 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  52.08 
 
 
530 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  39.28 
 
 
555 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 
537 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
547 aa  369  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  39.85 
 
 
527 aa  345  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 
536 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 
533 aa  336  7.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  39.59 
 
 
539 aa  335  7.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 
537 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 
549 aa  322  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  38.16 
 
 
533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
536 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  35.46 
 
 
530 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 
516 aa  314  1.9999999999999998e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 
518 aa  309  9e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 
552 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 
535 aa  307  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 
536 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  38.25 
 
 
532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  38.06 
 
 
532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
535 aa  299  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 
532 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 
534 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
559 aa  276  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 
554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
554 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 
547 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
547 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
565 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 
536 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  31.65 
 
 
556 aa  237  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
564 aa  236  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.9 
 
 
510 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
556 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
561 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
563 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 
510 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
528 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
514 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
532 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  32.13 
 
 
510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
520 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  30.65 
 
 
545 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
520 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
520 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
520 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.07 
 
 
527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 
519 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
551 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
533 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
528 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
523 aa  159  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.96 
 
 
536 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.73 
 
 
529 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
531 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
531 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.71 
 
 
545 aa  151  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.42 
 
 
528 aa  147  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
523 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
524 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
527 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
531 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  26.5 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
534 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
531 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
530 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
530 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
517 aa  127  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
524 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  27.17 
 
 
548 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
526 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.26 
 
 
535 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
523 aa  120  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
516 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 
545 aa  117  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.32 
 
 
472 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.83 
 
 
470 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.5 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
506 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 
522 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
521 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  23.52 
 
 
506 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  28.75 
 
 
504 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  26.81 
 
 
465 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.86 
 
 
511 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 
497 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.71 
 
 
512 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.86 
 
 
511 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  24.52 
 
 
512 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>