More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2838 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
531 aa  1089    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  96.61 
 
 
531 aa  1014    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  96.61 
 
 
531 aa  1013    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  51.61 
 
 
530 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  52.08 
 
 
530 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  39.92 
 
 
555 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 
537 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  40.56 
 
 
547 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  40.6 
 
 
527 aa  350  4e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  40.73 
 
 
536 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 
533 aa  336  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 
539 aa  335  7.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  39.52 
 
 
533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
549 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 
536 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  35.65 
 
 
530 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 
516 aa  317  4e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 
536 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 
535 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  38.65 
 
 
532 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
552 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  38.46 
 
 
532 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 
518 aa  310  4e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 
532 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 
535 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 
534 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 
559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 
554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 
554 aa  273  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
547 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
547 aa  247  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 
536 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
565 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  31.71 
 
 
556 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
564 aa  236  8e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
556 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 
563 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 
561 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.22 
 
 
510 aa  226  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 
528 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
514 aa  211  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
532 aa  210  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  32.51 
 
 
510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
520 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  31.21 
 
 
545 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 
520 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 
520 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.07 
 
 
527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 
523 aa  173  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 
551 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 
528 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  28.15 
 
 
536 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
523 aa  161  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  29.7 
 
 
529 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
531 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
531 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.91 
 
 
545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 
524 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
528 aa  147  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
531 aa  143  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
530 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
531 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
530 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  27.94 
 
 
526 aa  137  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
530 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
524 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  27.55 
 
 
548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
534 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
430 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
517 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
505 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
523 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.26 
 
 
535 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
545 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  30.28 
 
 
504 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.83 
 
 
470 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.85 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 
502 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
522 aa  110  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.09 
 
 
506 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
497 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  27.08 
 
 
518 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.19 
 
 
517 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  26.81 
 
 
465 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 
497 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.71 
 
 
511 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
474 aa  103  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>