202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4519 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 506 aa  1020    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  51.59 
 
 		 474 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  51.17 
 
 		 474 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  46.3 
 
 		 476 aa  458  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  54.29 
 
 		 487 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  48.95 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  48.32 
 
 		 484 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  50.1 
 
 		 515 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  46.01 
 
 		 476 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  49.26 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  51.07 
 
 		 470 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  47.26 
 
 		 476 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  51.71 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  53.18 
 
 		 505 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  48.18 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  48.28 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  49.26 
 
 		 481 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  48.71 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  52.23 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  52.88 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  45.13 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  52.45 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  47.02 
 
 		 484 aa  363  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.02 
 
 		 469 aa  362  8e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.65 
 
 		 503 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  45.03 
 
 		 491 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  49.26 
 
 		 477 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  47.41 
 
 		 511 aa  352  8e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  45.01 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  43.43 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  43.31 
 
 		 482 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  44.07 
 
 		 482 aa  330  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  43.44 
 
 		 524 aa  329  9e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  41.91 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  40.41 
 
 		 491 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  40.41 
 
 		 491 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  40.37 
 
 		 496 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  40.72 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  42.44 
 
 		 487 aa  320  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  40.58 
 
 		 499 aa  320  6e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  40.72 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 		 491 aa  298  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 		 534 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.17 
 
 		 545 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  39.57 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 		 531 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 		 534 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 560 aa  233  9e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 530 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 530 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  35.26 
 
 		 530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 528 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 580 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  41.64 
 
 		 568 aa  206  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 523 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 533 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 522 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.88 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 559 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 554 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 		 531 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.96 
 
 		 564 aa  121  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 565 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 547 aa  116  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 536 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 514 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  25.47 
 
 		 556 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 561 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27.18 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  26.06 
 
 		 533 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 547 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  29.37 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 555 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.63 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 516 aa  104  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 		 563 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 552 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 536 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 537 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  28.4 
 
 		 510 aa  101  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 535 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 535 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 537 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 539 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 533 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 530 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>