192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0214 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 568 aa  1105    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  68.98 
 
 		 491 aa  362  8e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  66.05 
 
 		 503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  68.75 
 
 		 496 aa  349  7e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  61.17 
 
 		 487 aa  323  6e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  62.37 
 
 		 499 aa  323  7e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  54.8 
 
 		 479 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  54.95 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  54.95 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  40.36 
 
 		 491 aa  291  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  57.56 
 
 		 484 aa  290  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  54.61 
 
 		 476 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  53.26 
 
 		 482 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  53.47 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  52.08 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  52.43 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  54.27 
 
 		 480 aa  266  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  51.89 
 
 		 470 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  45.59 
 
 		 478 aa  259  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 		 477 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  50.95 
 
 		 487 aa  253  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  49.44 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.5 
 
 		 511 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  41.91 
 
 		 476 aa  240  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  51.12 
 
 		 505 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  44.94 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 484 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  49.24 
 
 		 515 aa  233  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  44.94 
 
 		 474 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  46.62 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  42.7 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  49.63 
 
 		 474 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  47.94 
 
 		 477 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  44.37 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  47.6 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  37.64 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  41.64 
 
 		 506 aa  207  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  49.06 
 
 		 474 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  46.04 
 
 		 437 aa  203  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.44 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  49.06 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 531 aa  150  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.04 
 
 		 545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 528 aa  137  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 534 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 530 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 530 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 560 aa  111  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.57 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 526 aa  102  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 533 aa  95.1  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 580 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 523 aa  90.9  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 531 aa  88.6  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  22.34 
 
 		 547 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.26 
 
 		 564 aa  77.8  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  30.45 
 
 		 532 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  30.45 
 
 		 532 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 		 523 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 554 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 532 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 537 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 539 aa  70.1  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  26.77 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 530 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.59 
 
 		 548 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 556 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 		 565 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  25.98 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  36.61 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.24 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  36.44 
 
 		 559 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 536 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  61.43 
 
 		 579 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  38.32 
 
 		 533 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.14 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  28.82 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 531 aa  57.8  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>