200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2655 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
579 aa  1119    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  40.67 
 
 
499 aa  307  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  40.53 
 
 
499 aa  290  6e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  31.8 
 
 
476 aa  283  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  58.39 
 
 
523 aa  259  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  26.8 
 
 
485 aa  230  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  27.82 
 
 
500 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  54.98 
 
 
488 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  56.69 
 
 
472 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  57.76 
 
 
502 aa  220  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  29.27 
 
 
467 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  51.92 
 
 
464 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  57.33 
 
 
470 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  52.71 
 
 
477 aa  206  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  47.08 
 
 
477 aa  203  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  44.87 
 
 
493 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  52.38 
 
 
468 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  47.62 
 
 
479 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  52.79 
 
 
518 aa  193  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  40.86 
 
 
473 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  46.73 
 
 
506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  46.43 
 
 
481 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  46.43 
 
 
481 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  46.43 
 
 
481 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  47.89 
 
 
480 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  46 
 
 
516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  47.13 
 
 
485 aa  183  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  38.2 
 
 
493 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  45.63 
 
 
499 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  49.57 
 
 
528 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  44.57 
 
 
495 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  40.66 
 
 
497 aa  170  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  39.22 
 
 
496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  46.12 
 
 
473 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  38.52 
 
 
489 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  38.52 
 
 
489 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  38.52 
 
 
489 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  38.52 
 
 
489 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  38.13 
 
 
489 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  36.05 
 
 
489 aa  160  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  36.32 
 
 
497 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  37.87 
 
 
489 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  37.87 
 
 
489 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  38.3 
 
 
489 aa  157  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0758535 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  37.87 
 
 
489 aa  156  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  37.87 
 
 
489 aa  156  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  36.86 
 
 
474 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  39.66 
 
 
496 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  45.17 
 
 
490 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  36.86 
 
 
476 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  37.87 
 
 
489 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  34.35 
 
 
498 aa  155  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  37.87 
 
 
489 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  37.45 
 
 
489 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  42.57 
 
 
489 aa  153  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  39.82 
 
 
490 aa  152  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  41.18 
 
 
490 aa  147  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  39.7 
 
 
485 aa  147  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  39.2 
 
 
520 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  39.2 
 
 
472 aa  145  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.31 
 
 
470 aa  140  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  32.41 
 
 
485 aa  134  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  37.14 
 
 
482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  34.72 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  27.04 
 
 
474 aa  84  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  29.79 
 
 
472 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  29.79 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  29.79 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  29.79 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  29.79 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  29.79 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  29.36 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  29.36 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  32.29 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  32.29 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  32.29 
 
 
472 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  31.64 
 
 
508 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  32.29 
 
 
472 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  32.29 
 
 
472 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  23.93 
 
 
485 aa  66.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.61 
 
 
538 aa  64.7  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  23.6 
 
 
502 aa  64.7  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  30.05 
 
 
493 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.62 
 
 
509 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.43 
 
 
500 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  23.57 
 
 
494 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  23.9 
 
 
494 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  29.58 
 
 
493 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  30.1 
 
 
508 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  23.51 
 
 
494 aa  57.4  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  23.9 
 
 
494 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  39.64 
 
 
497 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  60.56 
 
 
1324 aa  56.6  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  26.34 
 
 
488 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  27.8 
 
 
498 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  39.33 
 
 
511 aa  53.9  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.84 
 
 
548 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  31.97 
 
 
498 aa  51.6  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  26.36 
 
 
494 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  67.44 
 
 
286 aa  50.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>