More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4007 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  100 
 
 		 494 aa  1021    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  98.58 
 
 		 494 aa  1009    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  98.58 
 
 		 494 aa  1009    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  62.93 
 
 		 502 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  99.39 
 
 		 494 aa  1015    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  62.93 
 
 		 502 aa  655    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  37.68 
 
 		 502 aa  315  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  30.96 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  30.94 
 
 		 508 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.8 
 
 		 497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0613  carbohydrate kinase, FGGY  25.96 
 
 		 481 aa  143  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.116215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  28.22 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1584  carbohydrate kinase FGGY  28.73 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  24.89 
 
 		 502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  27.23 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  26.81 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  27.15 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  28.2 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0722  carbohydrate kinase, FGGY  27.44 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.67 
 
 		 500 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3636  carbohydrate kinase FGGY  24.6 
 
 		 503 aa  120  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  25.88 
 
 		 501 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0962  glycerol kinase  26.62 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  26.12 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  25.89 
 
 		 491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  26.14 
 
 		 496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  24.14 
 
 		 493 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.55 
 
 		 501 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  24.79 
 
 		 500 aa  116  8.999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  26.52 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1485  glycerol kinase  26.54 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00136931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  26.91 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  26.91 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  26.81 
 
 		 505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  26.81 
 
 		 497 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4817  glycerol kinase  26.25 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.274509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  26.74 
 
 		 500 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3522  carbohydrate kinase FGGY  25.19 
 
 		 504 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  27.19 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  24.74 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  25.44 
 
 		 499 aa  114  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  26.28 
 
 		 498 aa  114  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  26.86 
 
 		 506 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  26.98 
 
 		 492 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  25.97 
 
 		 505 aa  113  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0140  glycerol kinase  25.84 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0145191  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  26.19 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  26 
 
 		 515 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  24.84 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  23.8 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  24.35 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  28.54 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  25.93 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.21 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  22.65 
 
 		 496 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  24.16 
 
 		 499 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2590  glycerol kinase  24.61 
 
 		 483 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0112292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  25.27 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  24.4 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  23.96 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  24.4 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  24.19 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  25.49 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  25.49 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  25.49 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1515  glycerol kinase  25.71 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  24.49 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  25.43 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  25.81 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  26.97 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  24.62 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.67 
 
 		 505 aa  107  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  27.17 
 
 		 504 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  25.7 
 
 		 493 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.55 
 
 		 499 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  24.7 
 
 		 493 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  24.89 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  24.53 
 
 		 493 aa  106  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  22.4 
 
 		 489 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  24.45 
 
 		 482 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  24.45 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  24.78 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  25.43 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  26.46 
 
 		 502 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  24.4 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  25.16 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  24.89 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  25.43 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  25.53 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  24.45 
 
 		 482 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  24.09 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  25.66 
 
 		 507 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  25.81 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  25.05 
 
 		 496 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  24.67 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  25.43 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  24.89 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  26.02 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  26.33 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  24.19 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>