More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0347 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  100 
 
 		 502 aa  1025    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  42.55 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  42.02 
 
 		 512 aa  425  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  40.32 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  40.74 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  40.74 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  40.2 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  38.54 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  40 
 
 		 511 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  40 
 
 		 512 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  40.99 
 
 		 512 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  39.6 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  39.37 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  39.37 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  39.57 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  39.17 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  39.37 
 
 		 513 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  39.37 
 
 		 513 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  39.17 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  39.57 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  39.37 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  37.62 
 
 		 519 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  39.01 
 
 		 512 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  40.16 
 
 		 512 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  38.58 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  38.49 
 
 		 511 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  36.76 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  38.49 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  38.1 
 
 		 511 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  37.1 
 
 		 514 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  36.42 
 
 		 530 aa  359  6e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  36.17 
 
 		 506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  34.35 
 
 		 501 aa  336  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  39.37 
 
 		 486 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  34.44 
 
 		 489 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  33.47 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  33.13 
 
 		 524 aa  313  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.12 
 
 		 495 aa  290  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  35.21 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  33.13 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  33.13 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  34.48 
 
 		 500 aa  259  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.52 
 
 		 530 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  36.45 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.54 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  28.97 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.92 
 
 		 500 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  32.29 
 
 		 505 aa  233  6e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.99 
 
 		 492 aa  233  9e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.99 
 
 		 492 aa  233  9e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.04 
 
 		 499 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31.52 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.96 
 
 		 518 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  30.12 
 
 		 509 aa  226  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  30.74 
 
 		 496 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.55 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  30.86 
 
 		 503 aa  220  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  30.02 
 
 		 502 aa  220  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  27.5 
 
 		 499 aa  219  7e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.18 
 
 		 496 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  30.66 
 
 		 498 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  30.66 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  27.97 
 
 		 483 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  29.13 
 
 		 505 aa  213  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.6 
 
 		 515 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  30 
 
 		 506 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.54 
 
 		 509 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  28.46 
 
 		 510 aa  209  7e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.69 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  29.41 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.71 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27 
 
 		 497 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  27.86 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  28.38 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  28.43 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  28.43 
 
 		 517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.04 
 
 		 511 aa  200  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  28.06 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  30.43 
 
 		 508 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.54 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  30.02 
 
 		 487 aa  192  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.5 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  29.23 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  30.51 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  29.01 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.94 
 
 		 548 aa  182  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  26.77 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.27 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  27.44 
 
 		 488 aa  181  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  26.77 
 
 		 484 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  26.49 
 
 		 484 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  27.52 
 
 		 506 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  28.11 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  26.57 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  28.95 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25.49 
 
 		 538 aa  177  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  26.38 
 
 		 484 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.71 
 
 		 511 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1675  carbohydrate kinase, FGGY  28.81 
 
 		 492 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  27.38 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>