More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2505 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  85.6 
 
 		 490 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  86.82 
 
 		 491 aa  855    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  77.71 
 
 		 494 aa  781    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  85.8 
 
 		 490 aa  811    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  79.72 
 
 		 493 aa  799    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  86.41 
 
 		 493 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  100 
 
 		 493 aa  982    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  96.15 
 
 		 493 aa  930    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  84.18 
 
 		 493 aa  805    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  86.41 
 
 		 493 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  79.31 
 
 		 493 aa  779    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  86.41 
 
 		 493 aa  804    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  96.15 
 
 		 493 aa  926    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  98.99 
 
 		 493 aa  973    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  95.74 
 
 		 493 aa  921    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  96.15 
 
 		 493 aa  926    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  95.13 
 
 		 493 aa  940    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  85.8 
 
 		 490 aa  811    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  85.6 
 
 		 490 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  63.09 
 
 		 487 aa  621  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  59.06 
 
 		 496 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  55.65 
 
 		 486 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  54.41 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  55.12 
 
 		 488 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  53.8 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  56.59 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  52.98 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  52.98 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  52.98 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  52.77 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  56.39 
 
 		 492 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  56.21 
 
 		 492 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  53.18 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  52.98 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  56.39 
 
 		 492 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  52.98 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  53.39 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  55.6 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  53.07 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  56.32 
 
 		 488 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  56.01 
 
 		 492 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  53.39 
 
 		 484 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  56.32 
 
 		 488 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  57.38 
 
 		 486 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  51.74 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  52.46 
 
 		 484 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  51.74 
 
 		 484 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  57.38 
 
 		 486 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  54 
 
 		 486 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  53.09 
 
 		 486 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  51.53 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  54.51 
 
 		 475 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  56.91 
 
 		 492 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  52.05 
 
 		 483 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  54.51 
 
 		 475 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  54.51 
 
 		 475 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  54.51 
 
 		 475 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  57.14 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  53.37 
 
 		 485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  55.46 
 
 		 488 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  52.55 
 
 		 482 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  57.14 
 
 		 486 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  53.86 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  52.76 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  55.67 
 
 		 488 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  52.98 
 
 		 483 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  50.62 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  51.03 
 
 		 484 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  47.02 
 
 		 494 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  49.49 
 
 		 492 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  47.84 
 
 		 486 aa  455  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  54.41 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  49.79 
 
 		 484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  50 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  51.04 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  50.83 
 
 		 483 aa  444  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  49.38 
 
 		 489 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  50.42 
 
 		 485 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  52.64 
 
 		 526 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  53.68 
 
 		 485 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  50.41 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  49.79 
 
 		 478 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  49.59 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  49.5 
 
 		 508 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  52.77 
 
 		 479 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  48.34 
 
 		 481 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  49.38 
 
 		 478 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  49.59 
 
 		 478 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  45.95 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  49.17 
 
 		 480 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  48.88 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  44.88 
 
 		 492 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  41.74 
 
 		 500 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  43.36 
 
 		 518 aa  364  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  42.2 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  45.57 
 
 		 533 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  36.36 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  43.57 
 
 		 498 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  35.44 
 
 		 492 aa  332  9e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  35.44 
 
 		 492 aa  332  9e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>