More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0820 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
489 aa  1006    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  43.49 
 
 
506 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  41.68 
 
 
514 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  39.36 
 
 
513 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  39.76 
 
 
530 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  40.36 
 
 
512 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  39.16 
 
 
513 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  38.96 
 
 
513 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  39.16 
 
 
513 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  39.16 
 
 
513 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  38.96 
 
 
513 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  39.16 
 
 
513 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  39.16 
 
 
513 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  41.28 
 
 
519 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  40.6 
 
 
517 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  40.6 
 
 
517 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  40.73 
 
 
511 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  39.44 
 
 
518 aa  374  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  40.32 
 
 
511 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  40.52 
 
 
511 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  39.31 
 
 
512 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  40.52 
 
 
511 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  40.13 
 
 
486 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  40.04 
 
 
511 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  40.04 
 
 
512 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  40.24 
 
 
512 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  40.24 
 
 
512 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  38.26 
 
 
512 aa  360  4e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  38.35 
 
 
499 aa  359  6e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  39.84 
 
 
512 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  38.32 
 
 
513 aa  354  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  39.71 
 
 
524 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  37.63 
 
 
526 aa  345  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  39.3 
 
 
495 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  39.71 
 
 
501 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  35.47 
 
 
509 aa  336  5.999999999999999e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  35.15 
 
 
509 aa  335  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  34.44 
 
 
502 aa  327  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  35 
 
 
530 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  36.71 
 
 
513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  34.55 
 
 
476 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  34.55 
 
 
476 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  34.86 
 
 
476 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  28.63 
 
 
505 aa  250  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.32 
 
 
500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.96 
 
 
501 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  40.62 
 
 
333 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.6 
 
 
538 aa  229  7e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  28.31 
 
 
499 aa  227  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.43 
 
 
499 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.68 
 
 
500 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  28.23 
 
 
496 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.81 
 
 
483 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  31.03 
 
 
512 aa  220  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  28.54 
 
 
505 aa  219  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  30.48 
 
 
509 aa  219  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.34 
 
 
518 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.34 
 
 
515 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.6 
 
 
512 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.26 
 
 
502 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.97 
 
 
492 aa  217  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.97 
 
 
492 aa  217  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.5 
 
 
511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  30.21 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  29.15 
 
 
510 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.17 
 
 
509 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  29.9 
 
 
496 aa  213  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.44 
 
 
497 aa  212  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.57 
 
 
509 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  29.3 
 
 
506 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  31.51 
 
 
514 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  30.91 
 
 
508 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.7 
 
 
496 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  28.91 
 
 
512 aa  209  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  29.41 
 
 
498 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.76 
 
 
511 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  31.02 
 
 
515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.11 
 
 
503 aa  202  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  30.81 
 
 
515 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  30.81 
 
 
515 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  30.81 
 
 
515 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  33.03 
 
 
515 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  33.03 
 
 
515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  33.03 
 
 
520 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.99 
 
 
506 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  30.58 
 
 
472 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  28.95 
 
 
499 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.6 
 
 
503 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.67 
 
 
490 aa  194  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  28.35 
 
 
506 aa  193  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  30.93 
 
 
513 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  30.93 
 
 
513 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  30.93 
 
 
513 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  30.93 
 
 
513 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  26.2 
 
 
489 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  27.94 
 
 
488 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  29.27 
 
 
511 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  28.74 
 
 
517 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  30.93 
 
 
513 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  30.93 
 
 
513 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>