More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1598 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  65 
 
 
502 aa  666    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  67.68 
 
 
498 aa  701    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  72.38 
 
 
497 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  68.69 
 
 
500 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  66.12 
 
 
493 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  65.99 
 
 
500 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  61.97 
 
 
519 aa  641    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  65.3 
 
 
493 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  67.88 
 
 
500 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  65.91 
 
 
507 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  64.37 
 
 
501 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  65.78 
 
 
489 aa  669    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  64.55 
 
 
529 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  64.37 
 
 
500 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  64.79 
 
 
503 aa  672    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  63.66 
 
 
494 aa  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  100 
 
 
500 aa  1018    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  71.52 
 
 
497 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  69.96 
 
 
497 aa  703    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  65.24 
 
 
519 aa  673    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  65.38 
 
 
495 aa  666    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  66.19 
 
 
496 aa  668    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  68.08 
 
 
498 aa  704    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  64.96 
 
 
500 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  72.93 
 
 
497 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  65.71 
 
 
493 aa  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  60.24 
 
 
495 aa  617  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  60.24 
 
 
494 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  60.04 
 
 
494 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  59.55 
 
 
493 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  58.54 
 
 
501 aa  598  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  62.12 
 
 
497 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  58.62 
 
 
494 aa  593  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  58.98 
 
 
497 aa  593  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  60.04 
 
 
497 aa  586  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  55.69 
 
 
498 aa  571  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  55.06 
 
 
497 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.99 
 
 
496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  56.42 
 
 
496 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  54.58 
 
 
496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  53.64 
 
 
496 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  55.15 
 
 
494 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  56.42 
 
 
496 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  53.85 
 
 
498 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  53.85 
 
 
498 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  58.37 
 
 
496 aa  567  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  53.24 
 
 
499 aa  562  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  52.63 
 
 
496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  56.53 
 
 
520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  53.04 
 
 
496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  53.24 
 
 
496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.24 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  53.24 
 
 
496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  53.04 
 
 
496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  53.8 
 
 
514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  53.24 
 
 
496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  52.63 
 
 
496 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  53.6 
 
 
501 aa  560  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  55.49 
 
 
501 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  56.19 
 
 
505 aa  558  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  52.23 
 
 
496 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  57.52 
 
 
501 aa  551  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  55.35 
 
 
494 aa  551  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  56.48 
 
 
499 aa  553  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  54.34 
 
 
499 aa  553  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  55.1 
 
 
513 aa  548  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  56.62 
 
 
496 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  53.94 
 
 
499 aa  549  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  54.36 
 
 
495 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  53.27 
 
 
500 aa  548  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  53.33 
 
 
498 aa  548  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  54.83 
 
 
518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  54.83 
 
 
518 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  55.49 
 
 
499 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  54.83 
 
 
518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  54.83 
 
 
518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  54.83 
 
 
518 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  54 
 
 
500 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  52.69 
 
 
510 aa  544  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  54.83 
 
 
503 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  53.37 
 
 
516 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  54.83 
 
 
503 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  55.73 
 
 
496 aa  544  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2009  glycerol kinase  56.73 
 
 
495 aa  542  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.904533  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  54 
 
 
500 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  54 
 
 
500 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  53.8 
 
 
500 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  54 
 
 
500 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  53.46 
 
 
495 aa  541  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  55.6 
 
 
496 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  53.8 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  54.21 
 
 
500 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  53.67 
 
 
494 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  53.17 
 
 
510 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  52.65 
 
 
494 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  53.97 
 
 
497 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  57.58 
 
 
504 aa  539  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  52.86 
 
 
494 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  55.28 
 
 
507 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  53.25 
 
 
494 aa  538  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>