More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2620 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  88.47 
 
 		 504 aa  838    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  100 
 
 		 506 aa  1013    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  65.6 
 
 		 498 aa  628  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  59.84 
 
 		 496 aa  600  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  55.21 
 
 		 518 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  50.5 
 
 		 500 aa  554  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  58.25 
 
 		 511 aa  536  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  55.6 
 
 		 512 aa  534  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  54.06 
 
 		 509 aa  534  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  48.62 
 
 		 509 aa  528  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  54.86 
 
 		 515 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  51.22 
 
 		 502 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  51.09 
 
 		 511 aa  517  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  56.1 
 
 		 499 aa  505  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  47.6 
 
 		 501 aa  502  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  51.19 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  41.45 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  44.86 
 
 		 499 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  39.64 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  39.51 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  41.5 
 
 		 488 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  45.04 
 
 		 517 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  45.98 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  45.04 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  39.47 
 
 		 492 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  39.47 
 
 		 492 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  40.28 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  47.77 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  43.38 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  46.34 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  42.24 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  42.63 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  42.63 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  41.82 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  42.83 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  41.96 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  42.63 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  42.16 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  42.63 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  42.22 
 
 		 484 aa  363  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  41.43 
 
 		 486 aa  363  4e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  50.56 
 
 		 492 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  42.42 
 
 		 484 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  46.31 
 
 		 492 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  45.9 
 
 		 493 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  50.11 
 
 		 492 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  50.11 
 
 		 492 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  42.97 
 
 		 483 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  41.87 
 
 		 484 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  42.77 
 
 		 493 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  42.62 
 
 		 484 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  45.9 
 
 		 496 aa  360  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  41.68 
 
 		 484 aa  360  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  46.96 
 
 		 492 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  37.53 
 
 		 496 aa  359  7e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  43.27 
 
 		 494 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  38.95 
 
 		 494 aa  355  7.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  49.66 
 
 		 492 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  42.16 
 
 		 484 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  42.28 
 
 		 484 aa  353  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  44.35 
 
 		 493 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  42.57 
 
 		 486 aa  352  8e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  42.36 
 
 		 487 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  45.67 
 
 		 491 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  44.03 
 
 		 493 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  44.47 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  44.03 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  44.47 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  44.03 
 
 		 493 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  42.07 
 
 		 484 aa  350  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  37.52 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  42.7 
 
 		 492 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  41.25 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  44.4 
 
 		 501 aa  342  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  44.7 
 
 		 485 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  47.07 
 
 		 508 aa  340  5e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  44.47 
 
 		 485 aa  339  7e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  45.63 
 
 		 487 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  44.22 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  44.22 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  44 
 
 		 490 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  44 
 
 		 490 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  43.27 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  39.63 
 
 		 486 aa  333  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  40.82 
 
 		 482 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  43.56 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  43.56 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  43.56 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  40.61 
 
 		 495 aa  329  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  43.11 
 
 		 493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  42.38 
 
 		 486 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  41.82 
 
 		 491 aa  326  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  42.07 
 
 		 486 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  43.72 
 
 		 485 aa  323  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  40.85 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  42.38 
 
 		 475 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  42.38 
 
 		 475 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  42.38 
 
 		 475 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  43.12 
 
 		 478 aa  322  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  42.38 
 
 		 475 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>