More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0402 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  100 
 
 		 498 aa  980    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  67.07 
 
 		 496 aa  667    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  65.6 
 
 		 506 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  64.99 
 
 		 504 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  54.55 
 
 		 518 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  58.23 
 
 		 511 aa  531  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  55.21 
 
 		 509 aa  526  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  49.41 
 
 		 509 aa  518  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  47.39 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  49.12 
 
 		 511 aa  505  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  50 
 
 		 501 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  51.5 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  50.1 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  51.82 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  52.66 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  43.33 
 
 		 509 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  40.73 
 
 		 489 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  41.26 
 
 		 492 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  41.26 
 
 		 492 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  42.54 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  47.88 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  49.09 
 
 		 499 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  38.55 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  43.61 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  42.91 
 
 		 517 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  42.91 
 
 		 517 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  41.7 
 
 		 488 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  43.92 
 
 		 484 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  49.04 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  43.84 
 
 		 484 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  44.26 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  43.63 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  43.63 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  38.19 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  43.78 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  43.9 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  43.63 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  43.84 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  43.57 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  43.63 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  43.42 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  38.51 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  44.7 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  44.49 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  44.05 
 
 		 483 aa  372  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  43.42 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  43.57 
 
 		 493 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  45.15 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  43.94 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  43.24 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  38.97 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  43.04 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  42.77 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  43.24 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  41.53 
 
 		 495 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  43.66 
 
 		 485 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  43.36 
 
 		 493 aa  364  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  43.45 
 
 		 485 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  38.35 
 
 		 503 aa  363  3e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  42.83 
 
 		 484 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  43.57 
 
 		 493 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  42.86 
 
 		 491 aa  362  9e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  43.57 
 
 		 493 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  43.36 
 
 		 493 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  43.36 
 
 		 493 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  41.29 
 
 		 486 aa  360  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  43.36 
 
 		 493 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  43.83 
 
 		 478 aa  360  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  41.98 
 
 		 489 aa  360  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  41.1 
 
 		 484 aa  360  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  42.17 
 
 		 484 aa  359  6e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  43.36 
 
 		 493 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  42.17 
 
 		 484 aa  359  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  42.17 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  40.9 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  40.95 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  41.82 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  41.82 
 
 		 483 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  42.06 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  39.31 
 
 		 492 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  44.06 
 
 		 496 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  43.04 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  43.54 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  43.54 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  44.4 
 
 		 501 aa  352  8e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  43.33 
 
 		 490 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  43.33 
 
 		 490 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  43.83 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  43.48 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  43.48 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  43.48 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  44.33 
 
 		 478 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  38.81 
 
 		 488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  43.78 
 
 		 486 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  43.33 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  43.78 
 
 		 486 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  43.71 
 
 		 486 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  43.9 
 
 		 491 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  43.2 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  43.2 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>