More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0103 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  83.27 
 
 		 508 aa  832    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 508 aa  1003    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  29.6 
 
 		 502 aa  253  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.59 
 
 		 501 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  33.01 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  29.32 
 
 		 497 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.88 
 
 		 500 aa  220  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  33.92 
 
 		 511 aa  219  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  35.79 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.81 
 
 		 509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.62 
 
 		 518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.72 
 
 		 504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.59 
 
 		 512 aa  210  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.74 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  29.87 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.88 
 
 		 496 aa  206  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  31.65 
 
 		 512 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  36.02 
 
 		 481 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  33.01 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.35 
 
 		 498 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.46 
 
 		 500 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.64 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  33.4 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.54 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.36 
 
 		 515 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  31.66 
 
 		 526 aa  199  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0722  carbohydrate kinase, FGGY  33.27 
 
 		 491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.13 
 
 		 511 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.84 
 
 		 492 aa  193  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.84 
 
 		 492 aa  193  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.54 
 
 		 489 aa  193  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  31.2 
 
 		 499 aa  193  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  32.75 
 
 		 510 aa  192  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  31.85 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  30.88 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  28.52 
 
 		 519 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  31.38 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  33.94 
 
 		 499 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.27 
 
 		 496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  28.52 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  33.55 
 
 		 487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.19 
 
 		 509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  27.92 
 
 		 488 aa  183  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  25.59 
 
 		 506 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  31.33 
 
 		 494 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  32.51 
 
 		 514 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  31.76 
 
 		 491 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  33.33 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  30.67 
 
 		 494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.65 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  30.89 
 
 		 494 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.35 
 
 		 511 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  30.89 
 
 		 494 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  32.75 
 
 		 506 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  32.95 
 
 		 517 aa  180  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.85 
 
 		 498 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1584  carbohydrate kinase FGGY  24.9 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.49 
 
 		 498 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.77 
 
 		 498 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  28.32 
 
 		 512 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  29.12 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  25.58 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  32.75 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0613  carbohydrate kinase, FGGY  27.49 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.116215  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  27.84 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  32.08 
 
 		 508 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.71 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  33 
 
 		 492 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  33.33 
 
 		 506 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.51 
 
 		 498 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  30.57 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  28.6 
 
 		 501 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  27.71 
 
 		 528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  31.31 
 
 		 501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  29.94 
 
 		 503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  27.01 
 
 		 519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  26.89 
 
 		 519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1325  glycerol kinase  31.72 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.597803  normal  0.0494586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  29.22 
 
 		 498 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  29.22 
 
 		 498 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  29.22 
 
 		 498 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  29.22 
 
 		 498 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  29.22 
 
 		 498 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  29.67 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  29.41 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.66 
 
 		 548 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  28.84 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  29.2 
 
 		 472 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  27.4 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  29.03 
 
 		 498 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  28.38 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  32.01 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  29.41 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  29.2 
 
 		 472 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  26.1 
 
 		 503 aa  171  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  28.71 
 
 		 499 aa  170  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  28.84 
 
 		 498 aa  170  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  31.71 
 
 		 501 aa  170  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  31.1 
 
 		 486 aa  170  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  30.56 
 
 		 484 aa  170  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>