More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  80.08 
 
 
506 aa  833    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  72.87 
 
 
503 aa  739    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  64.61 
 
 
497 aa  660    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  71.71 
 
 
504 aa  727    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  63.45 
 
 
498 aa  641    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  73.16 
 
 
510 aa  746    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  100 
 
 
505 aa  1039    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  65.26 
 
 
498 aa  663    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  81.2 
 
 
505 aa  847    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  83.33 
 
 
505 aa  890    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  73.31 
 
 
505 aa  753    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  63.71 
 
 
499 aa  650    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  67.81 
 
 
502 aa  692    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  83.97 
 
 
504 aa  878    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  72.85 
 
 
504 aa  744    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  62.23 
 
 
499 aa  636    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  72.46 
 
 
504 aa  742    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  75.05 
 
 
514 aa  790    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  71 
 
 
504 aa  723    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  61.91 
 
 
514 aa  637    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  61.48 
 
 
510 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  61.48 
 
 
510 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  61.68 
 
 
510 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  61.2 
 
 
505 aa  631  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  58.65 
 
 
505 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  62.03 
 
 
500 aa  626  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  58.28 
 
 
503 aa  626  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  60.83 
 
 
517 aa  621  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  60.24 
 
 
499 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  61.24 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  62.7 
 
 
496 aa  610  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  60.12 
 
 
509 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  61.35 
 
 
505 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  59 
 
 
507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  59.68 
 
 
501 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  59 
 
 
507 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  61.35 
 
 
505 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  58.63 
 
 
499 aa  597  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  59.07 
 
 
500 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  61.2 
 
 
505 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  57.65 
 
 
507 aa  597  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  57.96 
 
 
509 aa  593  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  58.28 
 
 
504 aa  593  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  60.6 
 
 
505 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  59.76 
 
 
505 aa  588  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  59.15 
 
 
499 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  60.04 
 
 
510 aa  588  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  56.6 
 
 
498 aa  585  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  58.43 
 
 
501 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  59.56 
 
 
505 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  58.43 
 
 
501 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  60.36 
 
 
505 aa  587  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  58.23 
 
 
501 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  59.2 
 
 
506 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  57.4 
 
 
507 aa  581  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  56.89 
 
 
505 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  56.85 
 
 
522 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  55.16 
 
 
501 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  56.4 
 
 
505 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  53.72 
 
 
493 aa  555  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  54.51 
 
 
497 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  52.89 
 
 
499 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  53.92 
 
 
494 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  54.6 
 
 
495 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  52.19 
 
 
505 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  55.69 
 
 
501 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  54.33 
 
 
494 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  52.89 
 
 
499 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  54.33 
 
 
494 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  53.57 
 
 
500 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  52.98 
 
 
500 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  54.33 
 
 
494 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  54.33 
 
 
494 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  54.12 
 
 
494 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  54.37 
 
 
507 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  53.52 
 
 
494 aa  547  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  54.26 
 
 
504 aa  545  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  54.89 
 
 
505 aa  548  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  54.37 
 
 
507 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  54.12 
 
 
494 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  54.33 
 
 
507 aa  545  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  53.92 
 
 
494 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  54.37 
 
 
507 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  54.12 
 
 
494 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  53.59 
 
 
499 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  54.42 
 
 
494 aa  543  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  53.54 
 
 
496 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.54 
 
 
496 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  53.36 
 
 
502 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  53.54 
 
 
496 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  54.33 
 
 
505 aa  545  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  53.08 
 
 
502 aa  544  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  53.54 
 
 
496 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  53.39 
 
 
499 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  51.2 
 
 
500 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  53.13 
 
 
496 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  51.2 
 
 
500 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  53.02 
 
 
496 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  53.41 
 
 
495 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  53.16 
 
 
502 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>