More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7482 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  64.47 
 
 		 506 aa  637    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  63.02 
 
 		 505 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  80.16 
 
 		 510 aa  853    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  61.43 
 
 		 505 aa  642    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  63.1 
 
 		 504 aa  642    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  65.48 
 
 		 504 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  100 
 
 		 505 aa  1030    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  80.16 
 
 		 505 aa  821    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  94.05 
 
 		 505 aa  945    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  80.56 
 
 		 505 aa  826    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  80.75 
 
 		 505 aa  825    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  78.93 
 
 		 510 aa  810    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  79.96 
 
 		 510 aa  853    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  64.82 
 
 		 507 aa  673    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  80.75 
 
 		 505 aa  826    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  85.71 
 
 		 505 aa  894    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  66 
 
 		 498 aa  647    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  79.96 
 
 		 510 aa  853    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  79.56 
 
 		 505 aa  818    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  78.53 
 
 		 517 aa  825    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  82.14 
 
 		 506 aa  818    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  63.42 
 
 		 504 aa  632  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  63.82 
 
 		 504 aa  631  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  64.21 
 
 		 504 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  61.2 
 
 		 505 aa  622  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  59.44 
 
 		 503 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  59.44 
 
 		 514 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  61.2 
 
 		 505 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  62.9 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  62.15 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  63.67 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  64.46 
 
 		 496 aa  601  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  60.83 
 
 		 498 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  61.07 
 
 		 499 aa  598  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  60.04 
 
 		 499 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  60.76 
 
 		 499 aa  594  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  60.04 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  58.86 
 
 		 509 aa  588  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  61.23 
 
 		 509 aa  580  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  60.24 
 
 		 501 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  60.97 
 
 		 502 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  58.96 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  59.84 
 
 		 501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  59.84 
 
 		 501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  58.48 
 
 		 501 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  57.43 
 
 		 505 aa  566  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  58.25 
 
 		 499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  59.57 
 
 		 514 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  55.86 
 
 		 504 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.42 
 
 		 496 aa  559  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  53.91 
 
 		 510 aa  555  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  57.6 
 
 		 497 aa  557  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  55.02 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  54.78 
 
 		 497 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  54.67 
 
 		 498 aa  550  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  52.17 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  53.12 
 
 		 513 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  56.11 
 
 		 507 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  56.51 
 
 		 507 aa  537  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  55.11 
 
 		 505 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  55.91 
 
 		 522 aa  529  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  55.91 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  54.02 
 
 		 498 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  54.78 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  53.43 
 
 		 493 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  57 
 
 		 500 aa  527  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  51.38 
 
 		 527 aa  527  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  54.49 
 
 		 505 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  55.4 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  52.91 
 
 		 502 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  52.91 
 
 		 502 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  52.91 
 
 		 502 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  53.59 
 
 		 499 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  53 
 
 		 499 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  52.91 
 
 		 502 aa  522  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  51.3 
 
 		 498 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1472  glycerol kinase  52.46 
 
 		 510 aa  522  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  52.91 
 
 		 502 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  53.59 
 
 		 499 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  52.91 
 
 		 502 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  52.91 
 
 		 502 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  54.09 
 
 		 505 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  52.91 
 
 		 502 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  51.3 
 
 		 498 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  52.91 
 
 		 502 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  51.5 
 
 		 496 aa  519  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  51.7 
 
 		 496 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  53.29 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  51.5 
 
 		 496 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  52.81 
 
 		 495 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  52.79 
 
 		 505 aa  518  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  52.52 
 
 		 495 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  52.8 
 
 		 499 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  52.1 
 
 		 501 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  52.6 
 
 		 500 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  53.2 
 
 		 496 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1128  glycerol kinase  52.8 
 
 		 523 aa  520  1e-146  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  52.91 
 
 		 502 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  51.5 
 
 		 496 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  53.48 
 
 		 520 aa  520  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>