More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2094 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  79.72 
 
 
503 aa  859    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  65.61 
 
 
498 aa  674    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  62.82 
 
 
498 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  63.02 
 
 
499 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  62.43 
 
 
505 aa  653    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  60.99 
 
 
501 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  100 
 
 
505 aa  1039    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  60.04 
 
 
505 aa  632  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  59.84 
 
 
510 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  58.65 
 
 
505 aa  629  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  60.91 
 
 
510 aa  625  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  59.64 
 
 
506 aa  624  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  61.66 
 
 
504 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  61.31 
 
 
504 aa  627  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  59.09 
 
 
514 aa  627  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  59.44 
 
 
510 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  62.57 
 
 
501 aa  627  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  59.44 
 
 
510 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  59.6 
 
 
507 aa  627  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  60.4 
 
 
505 aa  625  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  62.55 
 
 
500 aa  621  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  59.8 
 
 
504 aa  623  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  61.43 
 
 
505 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  61.46 
 
 
505 aa  622  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  63.73 
 
 
496 aa  622  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  61.78 
 
 
501 aa  621  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  61.9 
 
 
509 aa  620  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  61.58 
 
 
501 aa  620  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  61.23 
 
 
499 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  58.61 
 
 
504 aa  619  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  61.03 
 
 
497 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  59.96 
 
 
505 aa  617  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  58.8 
 
 
517 aa  615  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  59.8 
 
 
504 aa  617  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  61.11 
 
 
503 aa  617  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  60.76 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  60.59 
 
 
505 aa  611  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  59.64 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  60.44 
 
 
499 aa  608  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  59.33 
 
 
510 aa  608  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  60.08 
 
 
504 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  59.76 
 
 
502 aa  600  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  57.94 
 
 
497 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  58.81 
 
 
505 aa  595  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  60.44 
 
 
506 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  59.8 
 
 
505 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  59.64 
 
 
499 aa  591  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  59.21 
 
 
505 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  57.09 
 
 
509 aa  588  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  59.21 
 
 
505 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  58.85 
 
 
500 aa  585  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  58.05 
 
 
505 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  58.56 
 
 
514 aa  581  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  55.91 
 
 
496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.71 
 
 
496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  55.85 
 
 
494 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  55.85 
 
 
494 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  58.76 
 
 
501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  55.56 
 
 
498 aa  561  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  55.04 
 
 
494 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  55.65 
 
 
494 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  55.85 
 
 
494 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  55.65 
 
 
494 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  54.64 
 
 
494 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  54.22 
 
 
496 aa  559  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  54.22 
 
 
496 aa  558  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  54.02 
 
 
496 aa  559  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  54.22 
 
 
496 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  54.84 
 
 
494 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  54.64 
 
 
494 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  54.22 
 
 
496 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  54.02 
 
 
496 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  54.67 
 
 
503 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  54.08 
 
 
507 aa  561  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  57.2 
 
 
507 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  54.67 
 
 
499 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  57 
 
 
507 aa  557  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  54.02 
 
 
496 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  54.67 
 
 
501 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  54.02 
 
 
496 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  56.18 
 
 
507 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  57.11 
 
 
522 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  54.08 
 
 
502 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  56.89 
 
 
505 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  53.48 
 
 
502 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  53.48 
 
 
502 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  54.08 
 
 
499 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  53.88 
 
 
502 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  53.88 
 
 
502 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  54.31 
 
 
502 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  53.48 
 
 
502 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  54.27 
 
 
499 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  53.48 
 
 
502 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  53.48 
 
 
502 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  53.75 
 
 
500 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  53.56 
 
 
500 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  53.88 
 
 
502 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  53.41 
 
 
496 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  53.48 
 
 
502 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  53.48 
 
 
502 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>