More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1395 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  100 
 
 
505 aa  1045    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  59.96 
 
 
505 aa  637    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  59.28 
 
 
503 aa  632  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  62.73 
 
 
498 aa  631  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  60.4 
 
 
501 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  58.66 
 
 
514 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  61.63 
 
 
504 aa  621  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  61.03 
 
 
504 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  59.2 
 
 
505 aa  617  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  60.28 
 
 
497 aa  615  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  60.97 
 
 
498 aa  611  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  60.12 
 
 
510 aa  613  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  58.08 
 
 
505 aa  608  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  58.76 
 
 
506 aa  605  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  61.31 
 
 
507 aa  607  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  59.32 
 
 
499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  60.28 
 
 
504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  60 
 
 
499 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  58.27 
 
 
499 aa  598  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  56.89 
 
 
505 aa  598  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  60.12 
 
 
500 aa  599  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  58.95 
 
 
499 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  59.2 
 
 
509 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  58.28 
 
 
505 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  59.27 
 
 
499 aa  591  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  59.92 
 
 
496 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  58.72 
 
 
499 aa  591  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  59.16 
 
 
503 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  57.57 
 
 
517 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  59.44 
 
 
501 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  58.17 
 
 
505 aa  591  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  59.24 
 
 
501 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  59.24 
 
 
501 aa  588  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  59.6 
 
 
504 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  56.51 
 
 
510 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  56.31 
 
 
510 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  57.55 
 
 
502 aa  585  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  56.31 
 
 
510 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  57.66 
 
 
504 aa  587  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  56.37 
 
 
504 aa  579  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  58.2 
 
 
500 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  57.77 
 
 
510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  58.03 
 
 
505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  57.43 
 
 
505 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  54.8 
 
 
497 aa  570  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  57.83 
 
 
522 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  57.43 
 
 
505 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  57.03 
 
 
507 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  58.03 
 
 
505 aa  569  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54 
 
 
496 aa  565  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  57.03 
 
 
509 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  58.17 
 
 
514 aa  566  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  57.09 
 
 
507 aa  567  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  53.91 
 
 
496 aa  567  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  57.43 
 
 
505 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  57.34 
 
 
507 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  58.2 
 
 
506 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  54.37 
 
 
501 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  57.14 
 
 
505 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  57.52 
 
 
505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  55.87 
 
 
494 aa  561  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  54.89 
 
 
498 aa  558  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  57.03 
 
 
505 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  53.61 
 
 
498 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  55.93 
 
 
502 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  53.91 
 
 
494 aa  549  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  53 
 
 
505 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  53.91 
 
 
499 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  54.22 
 
 
496 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  53 
 
 
500 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  53 
 
 
500 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  53 
 
 
500 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  53 
 
 
500 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  54.44 
 
 
496 aa  544  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  53.71 
 
 
499 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  52.4 
 
 
500 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  52.8 
 
 
500 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  55.62 
 
 
496 aa  540  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  53.66 
 
 
501 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  54.76 
 
 
501 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  53.85 
 
 
507 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  53.27 
 
 
501 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  53.82 
 
 
496 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  52.8 
 
 
505 aa  537  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  53.27 
 
 
500 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  53.07 
 
 
500 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  53.85 
 
 
505 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  52.71 
 
 
496 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  53.91 
 
 
499 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  53.31 
 
 
513 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  52.8 
 
 
497 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  52.07 
 
 
500 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  50.3 
 
 
496 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  50.88 
 
 
510 aa  533  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  53.65 
 
 
505 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  53.74 
 
 
494 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  53.07 
 
 
502 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  53.54 
 
 
494 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  52.87 
 
 
502 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  52.2 
 
 
503 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>