More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0497 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  100 
 
 		 507 aa  1025    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  67.27 
 
 		 502 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  67.07 
 
 		 497 aa  680    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  96.45 
 
 		 507 aa  975    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  61.68 
 
 		 506 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  69.11 
 
 		 500 aa  693    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  61.29 
 
 		 505 aa  634    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  59.6 
 
 		 505 aa  637    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  78.13 
 
 		 507 aa  783    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  69.94 
 
 		 499 aa  698    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  71.11 
 
 		 522 aa  704    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  77.2 
 
 		 505 aa  772    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  63.25 
 
 		 505 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  61.29 
 
 		 498 aa  619  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  59 
 
 		 505 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  60.69 
 
 		 504 aa  617  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  61.08 
 
 		 503 aa  611  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  63.58 
 
 		 502 aa  610  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  62.02 
 
 		 500 aa  609  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  60.2 
 
 		 498 aa  609  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  58.19 
 
 		 514 aa  608  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  60.76 
 
 		 504 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  60.92 
 
 		 504 aa  606  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  59.15 
 
 		 504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  59.64 
 
 		 504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  59.88 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  61.34 
 
 		 501 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  60.48 
 
 		 499 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  59.17 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  59.72 
 
 		 505 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  58.88 
 
 		 507 aa  585  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  57.26 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  61.61 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  62.07 
 
 		 501 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  57.09 
 
 		 503 aa  585  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  61.66 
 
 		 501 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  58.55 
 
 		 499 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  61.46 
 
 		 501 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  58.99 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  59.96 
 
 		 504 aa  580  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  57.2 
 
 		 505 aa  578  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  60.32 
 
 		 509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  57.03 
 
 		 505 aa  568  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  58.91 
 
 		 496 aa  565  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5304  glycerol kinase  58.85 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  56 
 
 		 510 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  56.2 
 
 		 510 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  56.97 
 
 		 517 aa  558  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  56.2 
 
 		 510 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  55.8 
 
 		 510 aa  552  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  57.11 
 
 		 505 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  58.2 
 
 		 506 aa  541  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  56.11 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  56.31 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  55.91 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  53.43 
 
 		 496 aa  538  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  56.51 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  56.31 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  55.91 
 
 		 505 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  53.02 
 
 		 496 aa  530  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  52.36 
 
 		 509 aa  524  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  50.9 
 
 		 498 aa  521  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  53.97 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  51.06 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  51.1 
 
 		 499 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  52.76 
 
 		 505 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  50.87 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  48.9 
 
 		 500 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  48.7 
 
 		 500 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  50.7 
 
 		 500 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  50.4 
 
 		 503 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  50.4 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  50.4 
 
 		 503 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  50.3 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  53.02 
 
 		 501 aa  505  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  49.6 
 
 		 500 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  50.4 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  50.7 
 
 		 499 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  49.6 
 
 		 500 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  49.6 
 
 		 500 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  50.9 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  49.8 
 
 		 500 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  49.6 
 
 		 500 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  48.32 
 
 		 501 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  50.4 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  50.4 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  50.4 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  51.17 
 
 		 510 aa  502  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  50.58 
 
 		 527 aa  503  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  50.3 
 
 		 499 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  50.4 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  50.2 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  52.81 
 
 		 496 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  49.19 
 
 		 497 aa  502  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  52.3 
 
 		 498 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  53.21 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  50.51 
 
 		 499 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  50.4 
 
 		 501 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  51.57 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  50.3 
 
 		 499 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>