More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4220 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  63.27 
 
 		 499 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  66.93 
 
 		 501 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  63.86 
 
 		 500 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  66.2 
 
 		 501 aa  654    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  75.75 
 
 		 499 aa  753    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  61.9 
 
 		 505 aa  641    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  100 
 
 		 509 aa  1028    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  80.16 
 
 		 499 aa  820    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  63.49 
 
 		 503 aa  654    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  67.33 
 
 		 501 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  63.53 
 
 		 498 aa  644    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  61.68 
 
 		 504 aa  635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  67.54 
 
 		 499 aa  678    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  70.18 
 
 		 504 aa  714    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  62.15 
 
 		 506 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  67.13 
 
 		 501 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  62.28 
 
 		 504 aa  631  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  61.2 
 
 		 505 aa  634  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  61 
 
 		 504 aa  629  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  61.92 
 
 		 499 aa  628  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  60.12 
 
 		 505 aa  628  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  62.75 
 
 		 505 aa  624  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  62.7 
 
 		 510 aa  624  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  61.88 
 
 		 504 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  59.64 
 
 		 505 aa  624  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  58.96 
 
 		 514 aa  621  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  61.83 
 
 		 505 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  59.92 
 
 		 498 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  60.24 
 
 		 497 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  60.44 
 
 		 510 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  60.2 
 
 		 504 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  63.23 
 
 		 496 aa  607  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  60.44 
 
 		 510 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  60.64 
 
 		 510 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  60.16 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  62.88 
 
 		 502 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  59.2 
 
 		 505 aa  598  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  60.8 
 
 		 503 aa  600  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  60 
 
 		 507 aa  599  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  61.08 
 
 		 499 aa  598  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  61.08 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  60.64 
 
 		 505 aa  589  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  61.82 
 
 		 522 aa  587  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  61 
 
 		 505 aa  585  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  60.2 
 
 		 507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  61.23 
 
 		 505 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  61.43 
 
 		 505 aa  581  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  59.24 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  59.44 
 
 		 505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  60.32 
 
 		 507 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  59.24 
 
 		 500 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  59.01 
 
 		 507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  60.04 
 
 		 505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  59.24 
 
 		 505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  59.84 
 
 		 506 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  55.49 
 
 		 499 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  54.6 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  54.09 
 
 		 505 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  54.49 
 
 		 500 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  54.49 
 
 		 500 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  54.49 
 
 		 500 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  59.4 
 
 		 502 aa  549  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  54.09 
 
 		 500 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  54.09 
 
 		 500 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  53.89 
 
 		 500 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  54.09 
 
 		 503 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  54.09 
 
 		 503 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  53.89 
 
 		 500 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  56.69 
 
 		 514 aa  546  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  55.14 
 
 		 509 aa  545  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  54 
 
 		 499 aa  548  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  53.48 
 
 		 498 aa  547  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  54.09 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  54.09 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  54.09 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  54.09 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  54.09 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.12 
 
 		 496 aa  541  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  53.8 
 
 		 496 aa  542  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  56.36 
 
 		 496 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  52.6 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  54.02 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  54.83 
 
 		 505 aa  531  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  52.2 
 
 		 500 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  55.65 
 
 		 501 aa  526  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  56.05 
 
 		 496 aa  528  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  53.55 
 
 		 494 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  54.22 
 
 		 520 aa  527  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  52.87 
 
 		 497 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  53.31 
 
 		 497 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  51.1 
 
 		 497 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  52.41 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  54.53 
 
 		 498 aa  522  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  54.49 
 
 		 496 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  51.2 
 
 		 502 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  51.71 
 
 		 501 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  52.35 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  50.81 
 
 		 494 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  51.51 
 
 		 502 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  52.31 
 
 		 505 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>