More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1676 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  65.66 
 
 		 498 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  74.19 
 
 		 496 aa  745    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  62.24 
 
 		 496 aa  649    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  65.45 
 
 		 503 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  65.45 
 
 		 518 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  65.92 
 
 		 502 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  64.02 
 
 		 516 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  65.04 
 
 		 500 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  65.45 
 
 		 503 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  61.34 
 
 		 501 aa  656    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  64.84 
 
 		 505 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  100 
 
 		 496 aa  986    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  64.91 
 
 		 497 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  65.45 
 
 		 500 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  64.23 
 
 		 499 aa  670    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  60.65 
 
 		 497 aa  644    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  60.32 
 
 		 501 aa  638    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  64.63 
 
 		 500 aa  684    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  64.02 
 
 		 499 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  62.88 
 
 		 496 aa  675    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  63.08 
 
 		 510 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  63.08 
 
 		 498 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  69.25 
 
 		 505 aa  696    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  60.37 
 
 		 498 aa  650    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  64.43 
 
 		 500 aa  685    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  64.02 
 
 		 499 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  64.91 
 
 		 497 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  64.63 
 
 		 500 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  64.43 
 
 		 500 aa  685    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  73.19 
 
 		 496 aa  741    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  64.43 
 
 		 500 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  65.45 
 
 		 513 aa  681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  64.63 
 
 		 497 aa  655    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  65.45 
 
 		 518 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  65.45 
 
 		 518 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  68.07 
 
 		 496 aa  684    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  68.02 
 
 		 520 aa  685    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  65.45 
 
 		 518 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  65.45 
 
 		 518 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  62.68 
 
 		 496 aa  674    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  63.49 
 
 		 497 aa  631  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  60.74 
 
 		 496 aa  628  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  63.97 
 
 		 498 aa  626  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  62.75 
 
 		 505 aa  626  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  62.15 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  58.91 
 
 		 489 aa  627  1e-178  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  63.77 
 
 		 498 aa  627  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  65.66 
 
 		 497 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  61.54 
 
 		 503 aa  621  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  63.56 
 
 		 501 aa  624  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  57.2 
 
 		 496 aa  618  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  57.4 
 
 		 496 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  60.69 
 
 		 498 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  57.61 
 
 		 496 aa  619  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  60.12 
 
 		 494 aa  619  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  57.4 
 
 		 496 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  60.94 
 
 		 496 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  57.4 
 
 		 496 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  57.4 
 
 		 496 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  57.4 
 
 		 496 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  60.4 
 
 		 499 aa  615  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  57.4 
 
 		 496 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  57.37 
 
 		 507 aa  615  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  57.4 
 
 		 496 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  57.4 
 
 		 496 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  62.07 
 
 		 497 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  61.66 
 
 		 497 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  63.43 
 
 		 499 aa  608  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  56.39 
 
 		 494 aa  605  9.999999999999999e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  56.1 
 
 		 494 aa  605  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  58.18 
 
 		 500 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  58.67 
 
 		 501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3678  glycerol kinase  62.47 
 
 		 496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  57.78 
 
 		 500 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  60.77 
 
 		 507 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  56.88 
 
 		 501 aa  598  1e-170  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1315  glycerol kinase  64.37 
 
 		 495 aa  600  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  59.23 
 
 		 509 aa  599  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  62.14 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  57.61 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  57.61 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  60.29 
 
 		 498 aa  595  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  57.77 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  59.35 
 
 		 494 aa  595  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  57.4 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  57.4 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  57.61 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  57.61 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  57.61 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  58.3 
 
 		 503 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  59.27 
 
 		 498 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  57.61 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  57.4 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  59.43 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  59.35 
 
 		 494 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  57.61 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  57.61 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  60.45 
 
 		 495 aa  597  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  57.61 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  57.4 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>