More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3399 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  100 
 
 		 497 aa  1014    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  65.92 
 
 		 498 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  65.72 
 
 		 498 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  65.72 
 
 		 498 aa  678    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1023  glycerol kinase  78.9 
 
 		 498 aa  767    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3678  glycerol kinase  75.25 
 
 		 496 aa  756    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  78.3 
 
 		 497 aa  799    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  79.96 
 
 		 498 aa  808    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  64.06 
 
 		 505 aa  649    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  71.43 
 
 		 497 aa  733    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0602  glycerol kinase  78.93 
 
 		 506 aa  771    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  78.3 
 
 		 497 aa  780    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  80.16 
 
 		 498 aa  808    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2324  glycerol kinase  74.71 
 
 		 511 aa  752    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  72.89 
 
 		 499 aa  741    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  61.17 
 
 		 520 aa  632  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  58.3 
 
 		 496 aa  628  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  62.98 
 
 		 496 aa  630  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  58.3 
 
 		 496 aa  628  1e-179  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  62.15 
 
 		 496 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  58.91 
 
 		 500 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  63.01 
 
 		 510 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  58.7 
 
 		 500 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  58.91 
 
 		 505 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  58.94 
 
 		 497 aa  618  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  58.5 
 
 		 500 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  58.5 
 
 		 500 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  58.5 
 
 		 500 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  60.32 
 
 		 496 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  61.79 
 
 		 516 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  58.1 
 
 		 500 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  58.3 
 
 		 500 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  59.72 
 
 		 496 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  56.1 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  57.69 
 
 		 499 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  57.89 
 
 		 499 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  58.04 
 
 		 498 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  59.15 
 
 		 498 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  57.49 
 
 		 503 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  59.76 
 
 		 502 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  57.49 
 
 		 503 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  57.49 
 
 		 518 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  55.89 
 
 		 498 aa  602  1.0000000000000001e-171  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  57.49 
 
 		 518 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  57.49 
 
 		 518 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  57.49 
 
 		 518 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  57.49 
 
 		 518 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  57.29 
 
 		 499 aa  601  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  57.96 
 
 		 513 aa  598  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  57.98 
 
 		 497 aa  599  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  58.62 
 
 		 507 aa  598  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  55.85 
 
 		 501 aa  597  1e-169  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  58.18 
 
 		 496 aa  593  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  57.52 
 
 		 494 aa  594  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  57.29 
 
 		 497 aa  594  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  56.28 
 
 		 500 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  56.12 
 
 		 501 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  55.67 
 
 		 500 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  56.03 
 
 		 494 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  55.47 
 
 		 489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  55.83 
 
 		 494 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  55.83 
 
 		 494 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  56.19 
 
 		 498 aa  581  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  59.31 
 
 		 501 aa  581  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  54.79 
 
 		 495 aa  579  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  55.35 
 
 		 495 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  55.26 
 
 		 498 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  55.06 
 
 		 494 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  55.26 
 
 		 494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  55.26 
 
 		 494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  58.35 
 
 		 497 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  55.06 
 
 		 494 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  54.18 
 
 		 495 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  55.42 
 
 		 494 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  55.42 
 
 		 493 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  54.79 
 
 		 497 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  58.27 
 
 		 498 aa  574  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  52.64 
 
 		 494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  52.73 
 
 		 496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  52.53 
 
 		 496 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  52.73 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  52.53 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  52.53 
 
 		 496 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  52.53 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  52.53 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  52.42 
 
 		 496 aa  570  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  52.73 
 
 		 496 aa  571  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  54.66 
 
 		 503 aa  571  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  54.38 
 
 		 499 aa  569  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  52.53 
 
 		 496 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  54.14 
 
 		 507 aa  569  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  55.69 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  57.14 
 
 		 499 aa  566  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  54.08 
 
 		 499 aa  565  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  54.95 
 
 		 502 aa  566  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  54.6 
 
 		 494 aa  568  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  54.55 
 
 		 496 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  54.77 
 
 		 507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  54.77 
 
 		 507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  54.34 
 
 		 502 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>