More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0602 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  64.55 
 
 
498 aa  656    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  65.54 
 
 
498 aa  663    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1023  glycerol kinase  81.58 
 
 
498 aa  804    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  64.75 
 
 
498 aa  657    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3678  glycerol kinase  77.23 
 
 
496 aa  764    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  78.42 
 
 
497 aa  806    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  85.54 
 
 
498 aa  860    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  78.93 
 
 
497 aa  808    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0602  glycerol kinase  100 
 
 
506 aa  1023    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  77.82 
 
 
497 aa  783    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  86.14 
 
 
498 aa  869    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2324  glycerol kinase  80.51 
 
 
511 aa  810    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  71.29 
 
 
499 aa  713    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  72.71 
 
 
497 aa  746    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  57.65 
 
 
496 aa  628  1e-179  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  57.26 
 
 
496 aa  622  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  62.4 
 
 
505 aa  621  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  62.03 
 
 
496 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  60.83 
 
 
520 aa  615  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  61.71 
 
 
496 aa  615  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  59.05 
 
 
496 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  59.48 
 
 
502 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  56.09 
 
 
499 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  56.29 
 
 
499 aa  594  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  55.89 
 
 
500 aa  591  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  55.89 
 
 
503 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  58.05 
 
 
496 aa  588  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  55.89 
 
 
503 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  55.69 
 
 
500 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  55.49 
 
 
505 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  55.89 
 
 
499 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  55.89 
 
 
518 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  59.48 
 
 
510 aa  589  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  55.49 
 
 
500 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  55.89 
 
 
518 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  55.89 
 
 
518 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  55.89 
 
 
518 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  55.89 
 
 
518 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  59.28 
 
 
516 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  56.37 
 
 
497 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  55.29 
 
 
500 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  55.29 
 
 
500 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  55.29 
 
 
500 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  55.29 
 
 
500 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  54.29 
 
 
497 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  54.89 
 
 
498 aa  584  1.0000000000000001e-165  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  56.8 
 
 
498 aa  579  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  56.31 
 
 
513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  57.09 
 
 
496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  55.09 
 
 
494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  54.27 
 
 
489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  55.98 
 
 
497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  58.28 
 
 
498 aa  570  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  59.05 
 
 
497 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  53.88 
 
 
500 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  54.38 
 
 
498 aa  569  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  56.77 
 
 
507 aa  569  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  53.08 
 
 
500 aa  565  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  52.09 
 
 
501 aa  565  1e-160  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  56.29 
 
 
497 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  58.12 
 
 
499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  56.29 
 
 
499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  54.6 
 
 
497 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  54.8 
 
 
495 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  51.2 
 
 
496 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  51.2 
 
 
496 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  51.1 
 
 
494 aa  560  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  51.2 
 
 
496 aa  559  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  51.2 
 
 
496 aa  558  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  51.4 
 
 
496 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  54.78 
 
 
498 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  57.55 
 
 
502 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  56.09 
 
 
501 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  56.09 
 
 
499 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  51.3 
 
 
496 aa  561  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  51.4 
 
 
496 aa  561  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  56 
 
 
499 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  54.82 
 
 
493 aa  557  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  51.2 
 
 
496 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  53.11 
 
 
501 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  51.2 
 
 
496 aa  557  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  51.2 
 
 
496 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  57.34 
 
 
507 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  53.49 
 
 
495 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  56.77 
 
 
501 aa  553  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  54.4 
 
 
498 aa  551  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  54.22 
 
 
494 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  52.61 
 
 
494 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  55.89 
 
 
505 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  55.69 
 
 
505 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  54.22 
 
 
494 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  53.98 
 
 
493 aa  552  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  54.22 
 
 
494 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0041  glycerol kinase  52.89 
 
 
499 aa  548  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.684813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  54.8 
 
 
494 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  52.99 
 
 
496 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1315  glycerol kinase  59.05 
 
 
495 aa  550  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  54.6 
 
 
494 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  54.11 
 
 
494 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  53.69 
 
 
495 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>