More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4544 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  70.12 
 
 		 502 aa  756    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  70.12 
 
 		 502 aa  756    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  67.76 
 
 		 505 aa  723    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  70.82 
 
 		 499 aa  747    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  65.45 
 
 		 496 aa  659    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  60.69 
 
 		 499 aa  644    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  65.65 
 
 		 501 aa  670    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  71.2 
 
 		 503 aa  767    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  61.51 
 
 		 496 aa  659    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  70.41 
 
 		 502 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  80.89 
 
 		 494 aa  856    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  69.25 
 
 		 501 aa  737    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  61.51 
 
 		 496 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  61.51 
 
 		 496 aa  659    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  61.51 
 
 		 496 aa  658    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  61.1 
 
 		 496 aa  654    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  64.85 
 
 		 501 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  69.45 
 
 		 501 aa  740    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  70.12 
 
 		 502 aa  756    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  61.1 
 
 		 496 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  69.92 
 
 		 502 aa  756    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  69.72 
 
 		 502 aa  752    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  89.05 
 
 		 495 aa  926    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  70.12 
 
 		 502 aa  756    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  69.65 
 
 		 500 aa  745    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  65.04 
 
 		 494 aa  686    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  58.08 
 
 		 505 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  70.2 
 
 		 501 aa  742    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  69.26 
 
 		 504 aa  738    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  61.3 
 
 		 496 aa  658    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  61.51 
 
 		 496 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  66.26 
 
 		 494 aa  689    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  61.1 
 
 		 498 aa  653    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  61.1 
 
 		 498 aa  653    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  71.31 
 
 		 505 aa  760    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  70.39 
 
 		 503 aa  758    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  70.12 
 
 		 502 aa  756    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  71.6 
 
 		 503 aa  767    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  62.17 
 
 		 496 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  69.72 
 
 		 502 aa  752    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  69.67 
 
 		 505 aa  752    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  72.24 
 
 		 497 aa  756    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  73.27 
 
 		 507 aa  786    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  71.63 
 
 		 503 aa  769    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  70.12 
 
 		 502 aa  756    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  100 
 
 		 495 aa  1018    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  69.72 
 
 		 502 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  61.34 
 
 		 505 aa  648    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  62.98 
 
 		 505 aa  635    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  66.33 
 
 		 497 aa  701    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  58.69 
 
 		 500 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  64.23 
 
 		 498 aa  687    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  69.72 
 
 		 502 aa  752    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  69.72 
 
 		 502 aa  752    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  73.27 
 
 		 507 aa  786    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  65.85 
 
 		 500 aa  688    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  65.45 
 
 		 500 aa  687    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  81.71 
 
 		 494 aa  865    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  80.89 
 
 		 494 aa  853    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  80.69 
 
 		 494 aa  851    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  81.3 
 
 		 493 aa  861    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  73.93 
 
 		 498 aa  776    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  70.12 
 
 		 505 aa  748    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  58.49 
 
 		 500 aa  634    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  70.12 
 
 		 505 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  70.12 
 
 		 502 aa  756    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  61.51 
 
 		 496 aa  659    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  70.12 
 
 		 502 aa  756    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  73.27 
 
 		 507 aa  786    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  58.69 
 
 		 500 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  81.5 
 
 		 494 aa  860    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  68.85 
 
 		 505 aa  745    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  58.69 
 
 		 500 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  63.06 
 
 		 496 aa  668    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  80.86 
 
 		 498 aa  858    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  78.95 
 
 		 495 aa  835    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  70.61 
 
 		 499 aa  747    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  67.68 
 
 		 507 aa  720    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  62.86 
 
 		 496 aa  664    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  60.77 
 
 		 498 aa  637    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  82.32 
 
 		 494 aa  869    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  82.32 
 
 		 494 aa  869    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  70.12 
 
 		 502 aa  756    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  60.94 
 
 		 496 aa  635    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  82.52 
 
 		 494 aa  870    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  61.82 
 
 		 507 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  70.41 
 
 		 499 aa  746    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  82.52 
 
 		 494 aa  870    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  64.04 
 
 		 507 aa  683    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  58.28 
 
 		 500 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  58.49 
 
 		 503 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  59.35 
 
 		 501 aa  632  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  58.49 
 
 		 500 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  58.28 
 
 		 500 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  58.49 
 
 		 518 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  58.28 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  58.49 
 
 		 518 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  58.49 
 
 		 518 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  58.49 
 
 		 518 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  58.49 
 
 		 518 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>