More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1364 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  64.11 
 
 
502 aa  678    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  64.11 
 
 
502 aa  678    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  64.92 
 
 
502 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  63.23 
 
 
496 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  62.75 
 
 
499 aa  666    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  67.95 
 
 
496 aa  685    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  63.04 
 
 
499 aa  666    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  62.02 
 
 
496 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  68.52 
 
 
510 aa  694    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  63.36 
 
 
496 aa  668    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  62.99 
 
 
494 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  63.39 
 
 
494 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  61.38 
 
 
501 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  68.38 
 
 
496 aa  726    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  68.58 
 
 
496 aa  728    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  68.38 
 
 
496 aa  726    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  63.62 
 
 
503 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  68.15 
 
 
501 aa  722    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  62.3 
 
 
498 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  62.2 
 
 
501 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  62.99 
 
 
494 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  59.15 
 
 
502 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  64.72 
 
 
502 aa  682    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  59.92 
 
 
516 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  64.11 
 
 
502 aa  678    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  65.12 
 
 
502 aa  689    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  63.62 
 
 
503 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  60.56 
 
 
501 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  63.16 
 
 
500 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  64.11 
 
 
502 aa  678    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  63.21 
 
 
505 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  67.76 
 
 
496 aa  723    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  62.68 
 
 
496 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  63.82 
 
 
497 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  68.38 
 
 
496 aa  726    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0041  glycerol kinase  63.41 
 
 
499 aa  662    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.684813  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  63.04 
 
 
498 aa  675    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  64.02 
 
 
500 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  62.8 
 
 
500 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  63.08 
 
 
505 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  62.35 
 
 
499 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  62.42 
 
 
499 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  60.12 
 
 
499 aa  657    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  64.92 
 
 
507 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  63.77 
 
 
498 aa  681    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  64.23 
 
 
499 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  64.92 
 
 
502 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  63.19 
 
 
494 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  64.11 
 
 
502 aa  678    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  61.99 
 
 
500 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  62.75 
 
 
501 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  60.61 
 
 
510 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  61.69 
 
 
498 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  64.17 
 
 
505 aa  679    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  61.43 
 
 
495 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  61.99 
 
 
500 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  63.04 
 
 
498 aa  675    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  62.98 
 
 
503 aa  666    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  64.11 
 
 
502 aa  678    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  74.14 
 
 
497 aa  796    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  68.15 
 
 
500 aa  711    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  68.15 
 
 
500 aa  711    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  61.87 
 
 
504 aa  648    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  63.6 
 
 
494 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  63.6 
 
 
494 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  62.17 
 
 
493 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  63.11 
 
 
498 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  64.92 
 
 
502 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  62.6 
 
 
500 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  63.56 
 
 
505 aa  670    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  96.17 
 
 
496 aa  994    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  62.35 
 
 
499 aa  657    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  61.69 
 
 
509 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  63.36 
 
 
505 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  61.99 
 
 
500 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  63.6 
 
 
494 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  70.93 
 
 
498 aa  741    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  64.92 
 
 
507 aa  685    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  62.8 
 
 
499 aa  663    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  64.11 
 
 
502 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  100 
 
 
496 aa  1020    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  62.65 
 
 
495 aa  648    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  72.93 
 
 
489 aa  751    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  64.11 
 
 
502 aa  678    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  64.92 
 
 
502 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  62.8 
 
 
500 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  64.02 
 
 
497 aa  677    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  62.86 
 
 
495 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  64.23 
 
 
499 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  64.92 
 
 
502 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  63.62 
 
 
518 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  59.72 
 
 
499 aa  654    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  64.72 
 
 
507 aa  692    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  64.92 
 
 
507 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  63.62 
 
 
518 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  60.81 
 
 
505 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  62.78 
 
 
494 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  63.62 
 
 
518 aa  675    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  63.62 
 
 
518 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  67.28 
 
 
496 aa  719    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>