More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0476 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1023  glycerol kinase  81.65 
 
 
498 aa  785    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  67.2 
 
 
498 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  73.13 
 
 
497 aa  746    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  66.6 
 
 
498 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3678  glycerol kinase  79.64 
 
 
496 aa  788    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  100 
 
 
497 aa  1011    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  66.6 
 
 
498 aa  683    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  81.29 
 
 
498 aa  825    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  78.3 
 
 
497 aa  799    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0602  glycerol kinase  78.42 
 
 
506 aa  771    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  87.7 
 
 
497 aa  870    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  81.49 
 
 
498 aa  830    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2324  glycerol kinase  76.13 
 
 
511 aa  760    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  70.94 
 
 
499 aa  724    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  63.49 
 
 
496 aa  631  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  65.26 
 
 
505 aa  634  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  63.16 
 
 
496 aa  625  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  62.35 
 
 
520 aa  625  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  61.54 
 
 
496 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  61.13 
 
 
496 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  56.57 
 
 
496 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  56.16 
 
 
496 aa  611  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  57.96 
 
 
505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  58.94 
 
 
497 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  57.96 
 
 
499 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  57.76 
 
 
499 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  58.16 
 
 
499 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  57.55 
 
 
500 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  58.16 
 
 
513 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  59.92 
 
 
510 aa  591  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  58.86 
 
 
498 aa  592  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  57.14 
 
 
500 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  57.35 
 
 
500 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  58.45 
 
 
497 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  57.14 
 
 
500 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  57.14 
 
 
500 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  58.13 
 
 
497 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  56.59 
 
 
495 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  57.55 
 
 
500 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  57.52 
 
 
493 aa  588  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  57.23 
 
 
498 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  57.84 
 
 
498 aa  588  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  57.55 
 
 
500 aa  591  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  57.35 
 
 
503 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  57.35 
 
 
518 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  59.06 
 
 
516 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  57.35 
 
 
503 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  56.48 
 
 
501 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  56.21 
 
 
497 aa  585  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  57.35 
 
 
518 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  57.35 
 
 
518 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  57.35 
 
 
518 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  57.35 
 
 
518 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  56.5 
 
 
494 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  58.62 
 
 
502 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  56.39 
 
 
495 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  56.5 
 
 
494 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  56.5 
 
 
494 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  58.98 
 
 
496 aa  578  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  56.3 
 
 
494 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  55.19 
 
 
498 aa  577  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  54.55 
 
 
489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  54.58 
 
 
501 aa  575  1.0000000000000001e-163  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  56.8 
 
 
495 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  55.89 
 
 
494 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  55.08 
 
 
494 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  58.5 
 
 
499 aa  571  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  55.67 
 
 
494 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  60.76 
 
 
497 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  54.88 
 
 
494 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  56.88 
 
 
507 aa  570  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  57 
 
 
499 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  55.38 
 
 
497 aa  567  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  52.44 
 
 
494 aa  567  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  54.88 
 
 
494 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  54.67 
 
 
494 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  56.91 
 
 
499 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  56.8 
 
 
501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  55.69 
 
 
498 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  56.8 
 
 
499 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  58.18 
 
 
498 aa  562  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  55.78 
 
 
493 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  53.35 
 
 
496 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  53.35 
 
 
496 aa  558  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  53.35 
 
 
496 aa  559  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  53.35 
 
 
496 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  53.35 
 
 
496 aa  558  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  53.35 
 
 
496 aa  558  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  53.35 
 
 
496 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  57.78 
 
 
501 aa  561  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  57.06 
 
 
497 aa  559  1e-158  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.35 
 
 
496 aa  558  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  53.55 
 
 
496 aa  557  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  55.78 
 
 
500 aa  558  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  53.33 
 
 
507 aa  555  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  52.83 
 
 
496 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  56.3 
 
 
529 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  54.45 
 
 
499 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  56.59 
 
 
505 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  54.67 
 
 
501 aa  551  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>