More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2324 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  81.89 
 
 
498 aa  842    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  64.3 
 
 
498 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  62.72 
 
 
498 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  74.71 
 
 
497 aa  768    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3678  glycerol kinase  74.95 
 
 
496 aa  754    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  76.13 
 
 
497 aa  782    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1023  glycerol kinase  79.88 
 
 
498 aa  788    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  69.8 
 
 
497 aa  727    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  62.52 
 
 
498 aa  643    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0602  glycerol kinase  80.51 
 
 
506 aa  787    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  77.51 
 
 
497 aa  770    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  83.27 
 
 
498 aa  860    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2324  glycerol kinase  100 
 
 
511 aa  1029    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  68.82 
 
 
499 aa  692    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  61.48 
 
 
505 aa  616  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.91 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  55.71 
 
 
496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  59.02 
 
 
520 aa  599  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  60.24 
 
 
496 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  58.07 
 
 
496 aa  594  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  57.87 
 
 
496 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  59.02 
 
 
496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  58.7 
 
 
502 aa  580  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  54.92 
 
 
505 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  54.53 
 
 
500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  55.12 
 
 
499 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  57.91 
 
 
510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  54.92 
 
 
499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  56.92 
 
 
516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  52.96 
 
 
497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  54.74 
 
 
497 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  54.92 
 
 
500 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  54.33 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  54.33 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  54.33 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  54.33 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  54.72 
 
 
500 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  56.63 
 
 
498 aa  571  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  54.13 
 
 
499 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  54.53 
 
 
503 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  54.53 
 
 
503 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  54.53 
 
 
518 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  54.53 
 
 
518 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  54.53 
 
 
518 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  54.53 
 
 
518 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  54.53 
 
 
518 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  53.16 
 
 
498 aa  563  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  57.09 
 
 
498 aa  559  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  52.55 
 
 
501 aa  561  1e-158  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  54.56 
 
 
513 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  54.42 
 
 
497 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  57 
 
 
501 aa  557  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  54.04 
 
 
498 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  58.82 
 
 
497 aa  558  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  53.95 
 
 
494 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  54.74 
 
 
499 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  51.57 
 
 
489 aa  553  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  54.74 
 
 
499 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  53.57 
 
 
501 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  53.66 
 
 
495 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  54.46 
 
 
499 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  53.75 
 
 
498 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  53.94 
 
 
497 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  53.07 
 
 
495 aa  548  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  52.26 
 
 
494 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  54.22 
 
 
496 aa  548  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  54.08 
 
 
493 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  55.23 
 
 
507 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  53.83 
 
 
496 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  49.9 
 
 
496 aa  546  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  56.35 
 
 
499 aa  545  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  53.35 
 
 
494 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  53.35 
 
 
494 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  54.15 
 
 
501 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  49.9 
 
 
496 aa  545  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  50 
 
 
496 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  53.35 
 
 
494 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  53.48 
 
 
494 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  49.71 
 
 
496 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  49.71 
 
 
496 aa  544  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  49.71 
 
 
496 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  53.28 
 
 
494 aa  544  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  51.46 
 
 
507 aa  543  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  49.71 
 
 
496 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  49.71 
 
 
496 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  53.07 
 
 
499 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  51.67 
 
 
500 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  51.28 
 
 
500 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  53.28 
 
 
494 aa  541  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  49.71 
 
 
496 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  50.1 
 
 
496 aa  544  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  53.15 
 
 
494 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  52.78 
 
 
499 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  53.08 
 
 
494 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  53.08 
 
 
494 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  54.15 
 
 
505 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  52.25 
 
 
502 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  53.37 
 
 
500 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  52.25 
 
 
502 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  52.25 
 
 
502 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>