More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3665 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  66.33 
 
 
498 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3678  glycerol kinase  70.42 
 
 
496 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  65.73 
 
 
498 aa  653    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  70.94 
 
 
497 aa  724    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1023  glycerol kinase  71.57 
 
 
498 aa  676    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  71.94 
 
 
497 aa  710    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  66.33 
 
 
498 aa  659    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  72.89 
 
 
497 aa  741    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  72.14 
 
 
498 aa  715    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0602  glycerol kinase  71.29 
 
 
506 aa  682    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  70.82 
 
 
497 aa  699    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  71.34 
 
 
498 aa  716    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2324  glycerol kinase  68.82 
 
 
511 aa  672    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  100 
 
 
499 aa  994    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  63.43 
 
 
496 aa  608  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  60.61 
 
 
520 aa  603  1.0000000000000001e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  60 
 
 
496 aa  598  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  62.11 
 
 
505 aa  599  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  62.85 
 
 
497 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  58.54 
 
 
500 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  58.33 
 
 
500 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  58.13 
 
 
500 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  60.48 
 
 
496 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  57.93 
 
 
505 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  58.1 
 
 
497 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  60.28 
 
 
496 aa  591  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  58.13 
 
 
500 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  58.13 
 
 
500 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  61.24 
 
 
498 aa  586  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  58.33 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  58.33 
 
 
518 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  60.61 
 
 
502 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  58.33 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  55.33 
 
 
496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  57.72 
 
 
500 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  58.33 
 
 
500 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  57.72 
 
 
499 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  58.33 
 
 
518 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  58.33 
 
 
518 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  58.33 
 
 
518 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  58.33 
 
 
518 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  57.32 
 
 
499 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  57.52 
 
 
499 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.33 
 
 
496 aa  581  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  56.14 
 
 
497 aa  578  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  57.34 
 
 
498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  56.45 
 
 
497 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  55.76 
 
 
495 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  56.71 
 
 
513 aa  565  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  58.42 
 
 
516 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  57.95 
 
 
501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  56.28 
 
 
494 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  56.25 
 
 
494 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  54.75 
 
 
495 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  54.86 
 
 
493 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  56.07 
 
 
494 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  56.07 
 
 
494 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  56.25 
 
 
494 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  56.07 
 
 
494 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  55.44 
 
 
495 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  56.05 
 
 
494 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  55.28 
 
 
496 aa  558  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  52.32 
 
 
497 aa  559  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  55.65 
 
 
494 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  58.04 
 
 
510 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  53.75 
 
 
501 aa  561  1e-158  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  55.73 
 
 
503 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  54.84 
 
 
500 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  58.06 
 
 
507 aa  561  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  56.05 
 
 
494 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  56.02 
 
 
499 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  55.65 
 
 
498 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  55.67 
 
 
494 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  54.23 
 
 
500 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  56.83 
 
 
505 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  55.62 
 
 
499 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  56.63 
 
 
505 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  55.53 
 
 
499 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  56.39 
 
 
498 aa  555  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  54.4 
 
 
502 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  52.94 
 
 
498 aa  553  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  55.15 
 
 
507 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  56.94 
 
 
499 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  55.15 
 
 
507 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  53.05 
 
 
501 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  55.15 
 
 
502 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  55.15 
 
 
507 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  55.22 
 
 
501 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  55.35 
 
 
503 aa  548  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  54.53 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  55.22 
 
 
501 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  55.22 
 
 
501 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  54.33 
 
 
502 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  55.15 
 
 
497 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  54.53 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  54.33 
 
 
502 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  54.53 
 
 
502 aa  547  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  54.53 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  54.33 
 
 
502 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  54.53 
 
 
502 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>