More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1021 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  64.52 
 
 		 499 aa  650    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  71.11 
 
 		 507 aa  704    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  70.91 
 
 		 507 aa  707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  71.72 
 
 		 507 aa  711    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  100 
 
 		 522 aa  1060    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  71.31 
 
 		 505 aa  706    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  61.54 
 
 		 497 aa  626  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  61.37 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  61.01 
 
 		 498 aa  613  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  58.63 
 
 		 505 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  63.16 
 
 		 500 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  59.56 
 
 		 506 aa  613  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  61.45 
 
 		 504 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  65.38 
 
 		 502 aa  613  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  62.02 
 
 		 504 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  60.81 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  61.01 
 
 		 499 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  61.49 
 
 		 510 aa  606  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  59.27 
 
 		 505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  61.41 
 
 		 499 aa  595  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  61.66 
 
 		 501 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  57.86 
 
 		 504 aa  595  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  58.18 
 
 		 499 aa  596  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  63.29 
 
 		 501 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  56.85 
 
 		 505 aa  592  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  63.29 
 
 		 501 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  58.27 
 
 		 504 aa  591  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  59.76 
 
 		 503 aa  594  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  63.29 
 
 		 501 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  56.51 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  60.53 
 
 		 502 aa  588  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  59.27 
 
 		 499 aa  591  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  61.82 
 
 		 509 aa  585  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  59.52 
 
 		 504 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  58.7 
 
 		 498 aa  586  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5304  glycerol kinase  60.97 
 
 		 507 aa  579  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  57.66 
 
 		 504 aa  581  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  57.11 
 
 		 510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  57.11 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  57.11 
 
 		 510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  56.71 
 
 		 503 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  57.31 
 
 		 510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  57.83 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  57.86 
 
 		 499 aa  568  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  56.69 
 
 		 517 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  57.11 
 
 		 505 aa  568  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  58.6 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  59.37 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  55.91 
 
 		 510 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  57.2 
 
 		 496 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  56.91 
 
 		 505 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  56.51 
 
 		 505 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  55.11 
 
 		 505 aa  531  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  55.58 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  55.31 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  56.11 
 
 		 505 aa  534  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  56.91 
 
 		 506 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  55.91 
 
 		 505 aa  528  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  53.75 
 
 		 509 aa  527  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  51.72 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  51.2 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  51 
 
 		 498 aa  511  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  51.92 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  48.89 
 
 		 494 aa  501  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  49.61 
 
 		 513 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  50.8 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  51.21 
 
 		 496 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  48.4 
 
 		 500 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  47.6 
 
 		 500 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  49.8 
 
 		 493 aa  488  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  47.19 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  46.99 
 
 		 496 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  47.19 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  47.19 
 
 		 496 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  48.82 
 
 		 527 aa  491  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  48.5 
 
 		 501 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  46.99 
 
 		 496 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  46.99 
 
 		 496 aa  488  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  50.8 
 
 		 503 aa  491  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  49.32 
 
 		 510 aa  489  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  50.1 
 
 		 499 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  47.19 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  49.9 
 
 		 500 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_50770  predicted protein  50.19 
 
 		 549 aa  488  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  49.7 
 
 		 499 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  48.28 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  46.79 
 
 		 496 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  47.83 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  49.1 
 
 		 499 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  49.5 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  49.1 
 
 		 503 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  49.3 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  49.1 
 
 		 503 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  49.49 
 
 		 500 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  48.91 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  49.09 
 
 		 499 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  51.2 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  48.91 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  48.91 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  48.91 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>