More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_50770 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_50770  predicted protein  100 
 
 
549 aa  1144    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  50.19 
 
 
514 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  53.61 
 
 
504 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  53.96 
 
 
504 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  51.9 
 
 
504 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  51.63 
 
 
499 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  50.96 
 
 
505 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  50.86 
 
 
506 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  50.86 
 
 
505 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  49.43 
 
 
503 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  51.91 
 
 
504 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  52.08 
 
 
505 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  50.57 
 
 
499 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  51.73 
 
 
500 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  51.62 
 
 
510 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  51.34 
 
 
498 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  50.29 
 
 
510 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  50.29 
 
 
510 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  50.29 
 
 
510 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  49.62 
 
 
504 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  50.95 
 
 
503 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  52.6 
 
 
502 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  50.94 
 
 
510 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  49.9 
 
 
517 aa  491  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  50 
 
 
505 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  46.48 
 
 
505 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  50.38 
 
 
499 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  50.28 
 
 
505 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  51.13 
 
 
509 aa  488  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  51.71 
 
 
505 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  49.43 
 
 
498 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  49.81 
 
 
497 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  48.39 
 
 
505 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  49.81 
 
 
507 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  50.19 
 
 
499 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  51.24 
 
 
505 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  48.39 
 
 
504 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  51.06 
 
 
505 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  49.71 
 
 
501 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  49.81 
 
 
505 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  49.81 
 
 
505 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  47.79 
 
 
499 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  50 
 
 
505 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  51.54 
 
 
506 aa  475  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  50.1 
 
 
496 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  48.96 
 
 
499 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  48.22 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  50.76 
 
 
501 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  47.22 
 
 
496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  46.83 
 
 
496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  46.39 
 
 
500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  46.01 
 
 
500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  50 
 
 
505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  50.76 
 
 
501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  50.19 
 
 
522 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  50.76 
 
 
501 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  45.71 
 
 
497 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  47.32 
 
 
495 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  48.41 
 
 
507 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  46.53 
 
 
510 aa  464  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  48.13 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  46.78 
 
 
520 aa  457  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  45.76 
 
 
507 aa  458  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  46.51 
 
 
496 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  46.51 
 
 
496 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  45.76 
 
 
507 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  45.42 
 
 
498 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  45.76 
 
 
507 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  46.3 
 
 
503 aa  457  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  46.51 
 
 
496 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  49.43 
 
 
505 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  46.32 
 
 
496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  46.32 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  46.32 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  44.84 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  46.32 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  48.68 
 
 
507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  46.32 
 
 
496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  45.73 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  47.22 
 
 
495 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  45.28 
 
 
493 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  47.12 
 
 
494 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  48.02 
 
 
500 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  45.25 
 
 
513 aa  450  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  45.93 
 
 
496 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  45.44 
 
 
502 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  45.69 
 
 
513 aa  450  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  46.44 
 
 
498 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  46.6 
 
 
498 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  46.6 
 
 
498 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1472  glycerol kinase  45.88 
 
 
510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  46.73 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  46.45 
 
 
495 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  45.9 
 
 
496 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  44.7 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  46.73 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  46.73 
 
 
494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  46.42 
 
 
509 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  44.89 
 
 
500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  46.92 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>