More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4066 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  62.43 
 
 		 503 aa  652    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  99.4 
 
 		 501 aa  1006    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  63.05 
 
 		 498 aa  644    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  64.47 
 
 		 504 aa  646    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  62.8 
 
 		 500 aa  640    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  61.58 
 
 		 505 aa  649    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  73.59 
 
 		 501 aa  735    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  67.54 
 
 		 499 aa  671    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  100 
 
 		 501 aa  1012    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  66.93 
 
 		 509 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  67.54 
 
 		 499 aa  675    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  67.54 
 
 		 499 aa  659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  95.81 
 
 		 501 aa  948    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  61.32 
 
 		 506 aa  629  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  60.68 
 
 		 499 aa  628  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  61.24 
 
 		 498 aa  627  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  61.83 
 
 		 504 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  60.36 
 
 		 505 aa  626  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  60.69 
 
 		 497 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  59.04 
 
 		 505 aa  622  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  60.52 
 
 		 514 aa  621  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  61.95 
 
 		 504 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  62.75 
 
 		 504 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  62.87 
 
 		 510 aa  620  1e-176  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  62.03 
 
 		 505 aa  618  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  59.4 
 
 		 504 aa  616  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  58.43 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  63.36 
 
 		 496 aa  612  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  64.23 
 
 		 502 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  62.12 
 
 		 503 aa  611  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  61.03 
 
 		 505 aa  608  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  59.44 
 
 		 499 aa  604  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  60.16 
 
 		 504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  59.44 
 
 		 510 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  63.29 
 
 		 522 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  59.24 
 
 		 510 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  59.24 
 
 		 510 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  59.24 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  60.76 
 
 		 507 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  60.36 
 
 		 507 aa  596  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  61.34 
 
 		 500 aa  594  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  61.26 
 
 		 505 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  58.28 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  61.66 
 
 		 507 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  61.46 
 
 		 507 aa  588  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  59.72 
 
 		 499 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  58.76 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  59.84 
 
 		 505 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  59.24 
 
 		 505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  59.05 
 
 		 505 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  59.64 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  60.04 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  58.85 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  59.84 
 
 		 506 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  58.05 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  59.3 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  54.64 
 
 		 503 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  54.75 
 
 		 518 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  54.64 
 
 		 503 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  54.95 
 
 		 500 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.06 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  54.75 
 
 		 518 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  54.75 
 
 		 518 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  54.75 
 
 		 518 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  54.75 
 
 		 518 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  58.74 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  56.28 
 
 		 520 aa  549  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  55.13 
 
 		 513 aa  548  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  55.06 
 
 		 499 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  57 
 
 		 505 aa  549  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  54.23 
 
 		 500 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  54.23 
 
 		 500 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  54.23 
 
 		 500 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  55.06 
 
 		 499 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  55.58 
 
 		 496 aa  549  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.12 
 
 		 496 aa  551  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  55.87 
 
 		 496 aa  547  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  53.94 
 
 		 505 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  53.83 
 
 		 500 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  54.76 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  55.06 
 
 		 499 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  54.09 
 
 		 497 aa  545  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  57.89 
 
 		 496 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  53.19 
 
 		 498 aa  545  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  53.63 
 
 		 500 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  53.74 
 
 		 500 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  52.98 
 
 		 500 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  56.54 
 
 		 501 aa  538  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  52.93 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  52.58 
 
 		 500 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  59.68 
 
 		 502 aa  538  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  56.88 
 
 		 496 aa  532  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  53.59 
 
 		 510 aa  532  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  52.99 
 
 		 497 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  55.17 
 
 		 498 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  54.09 
 
 		 497 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  54.93 
 
 		 505 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  52.13 
 
 		 499 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  50.5 
 
 		 507 aa  525  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  52.53 
 
 		 502 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>