More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1798 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  67.41 
 
 
504 aa  672    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  64.81 
 
 
514 aa  693    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  64.92 
 
 
500 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  64.37 
 
 
514 aa  640    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  68.22 
 
 
505 aa  711    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  100 
 
 
502 aa  1030    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  68.83 
 
 
510 aa  684    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  68.69 
 
 
505 aa  681    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  71.29 
 
 
506 aa  735    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  64.99 
 
 
499 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  66.8 
 
 
505 aa  716    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  64.78 
 
 
498 aa  650    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  70.04 
 
 
504 aa  728    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  71.52 
 
 
504 aa  722    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  66.4 
 
 
496 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  68.83 
 
 
504 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  73.09 
 
 
503 aa  728    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  67.81 
 
 
505 aa  721    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  66.53 
 
 
497 aa  668    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  71.17 
 
 
504 aa  701    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  63.97 
 
 
498 aa  633  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  62.96 
 
 
499 aa  632  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  63.03 
 
 
500 aa  630  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  63.58 
 
 
505 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  59.76 
 
 
505 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  62.47 
 
 
499 aa  628  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  64.17 
 
 
507 aa  624  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  61.94 
 
 
499 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  62.73 
 
 
504 aa  625  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  62.15 
 
 
501 aa  623  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  65.45 
 
 
501 aa  621  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  64.1 
 
 
499 aa  622  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  64.84 
 
 
501 aa  618  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  64.19 
 
 
507 aa  621  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  61.75 
 
 
510 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  61.95 
 
 
510 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  61.75 
 
 
510 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  61.45 
 
 
507 aa  619  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  63.58 
 
 
507 aa  617  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  58.35 
 
 
503 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  64.23 
 
 
501 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  61.23 
 
 
517 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  62.88 
 
 
509 aa  610  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  61.62 
 
 
499 aa  606  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  60.53 
 
 
522 aa  595  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  61.66 
 
 
505 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  57.55 
 
 
505 aa  592  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  60.97 
 
 
505 aa  581  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  61.77 
 
 
506 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  60.97 
 
 
505 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  60.97 
 
 
505 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  60.56 
 
 
505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  59.56 
 
 
510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  60.97 
 
 
505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  60.97 
 
 
505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  60.76 
 
 
505 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  57.06 
 
 
509 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  59.24 
 
 
502 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  54.56 
 
 
496 aa  560  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  55.47 
 
 
498 aa  558  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  54.79 
 
 
499 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  54.79 
 
 
499 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.36 
 
 
496 aa  555  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  55.44 
 
 
498 aa  558  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  53.55 
 
 
496 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  53.14 
 
 
496 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  55.85 
 
 
520 aa  548  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  52.94 
 
 
496 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  53.14 
 
 
496 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.14 
 
 
496 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  53.56 
 
 
505 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  53.14 
 
 
496 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  52.94 
 
 
496 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  54.18 
 
 
499 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  53.23 
 
 
497 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  52.94 
 
 
496 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  52.94 
 
 
496 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  54.67 
 
 
496 aa  542  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  52.95 
 
 
518 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  55.22 
 
 
501 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  53.36 
 
 
500 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  52.95 
 
 
518 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  52.95 
 
 
518 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  52.95 
 
 
518 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  52.95 
 
 
518 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  54.4 
 
 
501 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  52.95 
 
 
503 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  54 
 
 
501 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  52.95 
 
 
503 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  56.91 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  52.75 
 
 
500 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  52.75 
 
 
500 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  52.75 
 
 
500 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  52.75 
 
 
500 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  53.63 
 
 
513 aa  535  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  52.61 
 
 
495 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  52.14 
 
 
500 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  53.42 
 
 
510 aa  536  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  52.34 
 
 
500 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  51.52 
 
 
496 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>