More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0389 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  72.6 
 
 
504 aa  726    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  64.68 
 
 
505 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  83.97 
 
 
505 aa  878    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  60.24 
 
 
503 aa  639    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  73.96 
 
 
514 aa  773    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  81.44 
 
 
505 aa  849    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  65.6 
 
 
498 aa  652    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  70.04 
 
 
502 aa  697    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  64.73 
 
 
497 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  63.37 
 
 
510 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  72.82 
 
 
504 aa  739    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  82.14 
 
 
505 aa  857    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  72.82 
 
 
504 aa  738    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  71.77 
 
 
510 aa  724    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  72.46 
 
 
504 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  68.4 
 
 
498 aa  686    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  100 
 
 
504 aa  1029    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  63.37 
 
 
510 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  75 
 
 
503 aa  743    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  65.13 
 
 
499 aa  659    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  73.27 
 
 
505 aa  748    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  78.77 
 
 
506 aa  809    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  62.97 
 
 
510 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  63.26 
 
 
514 aa  631  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  62.4 
 
 
499 aa  626  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  61.95 
 
 
499 aa  624  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  62.75 
 
 
517 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  64.85 
 
 
496 aa  621  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  58.61 
 
 
505 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  63.1 
 
 
505 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  63.17 
 
 
505 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  62.98 
 
 
499 aa  618  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  61.8 
 
 
499 aa  611  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  60.6 
 
 
504 aa  610  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  62.18 
 
 
505 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  61 
 
 
509 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  59.32 
 
 
500 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  58.73 
 
 
507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  62.38 
 
 
506 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  61.71 
 
 
510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  61.58 
 
 
505 aa  599  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  60.04 
 
 
501 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  60.48 
 
 
507 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  61.4 
 
 
499 aa  598  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  60.69 
 
 
507 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  60.59 
 
 
505 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  59.01 
 
 
509 aa  593  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  61.17 
 
 
500 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  59.8 
 
 
501 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  60.2 
 
 
505 aa  588  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  60.79 
 
 
505 aa  589  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  59.4 
 
 
501 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  59.27 
 
 
507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  59 
 
 
501 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  56.8 
 
 
498 aa  575  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  57.86 
 
 
522 aa  574  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  55.07 
 
 
497 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  57.66 
 
 
505 aa  567  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  57.46 
 
 
505 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  54.73 
 
 
499 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  54.53 
 
 
499 aa  555  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  54.95 
 
 
496 aa  551  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  53.52 
 
 
505 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  54.67 
 
 
493 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  56.4 
 
 
505 aa  548  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.95 
 
 
496 aa  549  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  53.78 
 
 
500 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  54.18 
 
 
500 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  54.91 
 
 
499 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  54.38 
 
 
520 aa  545  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  55.78 
 
 
501 aa  541  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  54.31 
 
 
502 aa  541  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  54.23 
 
 
501 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  54.62 
 
 
494 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  54.64 
 
 
495 aa  541  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  53.94 
 
 
499 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  53.52 
 
 
499 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  53.51 
 
 
496 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.51 
 
 
496 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  54.71 
 
 
499 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  54.67 
 
 
500 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  54.51 
 
 
501 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  54.27 
 
 
502 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  52.3 
 
 
500 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  53.51 
 
 
496 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  54.78 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  53.57 
 
 
507 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  54.27 
 
 
502 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  53.51 
 
 
496 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  54.27 
 
 
502 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  54.27 
 
 
502 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  54.82 
 
 
499 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  54.47 
 
 
502 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  54.16 
 
 
495 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  51.9 
 
 
503 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  53.68 
 
 
502 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  53.11 
 
 
496 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  53.54 
 
 
499 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  52.69 
 
 
500 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  52.69 
 
 
500 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>