More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0962 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1940  glycerol kinase  66.32 
 
 		 483 aa  654    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0962  glycerol kinase  100 
 
 		 483 aa  1004    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0140  glycerol kinase  64.45 
 
 		 493 aa  665    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0145191  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  67.22 
 
 		 483 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2590  glycerol kinase  68.61 
 
 		 483 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0112292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1515  glycerol kinase  66.74 
 
 		 484 aa  686    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  56.03 
 
 		 495 aa  557  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.21 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  54.81 
 
 		 497 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  54.9 
 
 		 500 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  54.69 
 
 		 500 aa  551  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  56.15 
 
 		 505 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  55.1 
 
 		 495 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.81 
 
 		 496 aa  553  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  56.17 
 
 		 498 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  55.49 
 
 		 494 aa  548  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  56.06 
 
 		 507 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  56.06 
 
 		 507 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  56.06 
 
 		 507 aa  547  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  55.42 
 
 		 495 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  53.78 
 
 		 497 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  55.74 
 
 		 498 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  54.92 
 
 		 494 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  56.24 
 
 		 504 aa  542  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  54.08 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  54.08 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  55.53 
 
 		 493 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  54.08 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  55.33 
 
 		 499 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  54.08 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  54.19 
 
 		 500 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  54.08 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  55.12 
 
 		 499 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  54.08 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  54.08 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  54.71 
 
 		 494 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  54.51 
 
 		 494 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  54.64 
 
 		 507 aa  538  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  54.08 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  54.41 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  54.41 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  53.89 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  52.46 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  52.76 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  54.58 
 
 		 502 aa  538  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  52.46 
 
 		 496 aa  537  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  54.92 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  52.46 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  52.46 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  55.42 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  52.76 
 
 		 496 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  54.27 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  52.46 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  51.94 
 
 		 496 aa  531  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  54.83 
 
 		 498 aa  534  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  54.3 
 
 		 494 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  52.46 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  54.71 
 
 		 494 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  54.71 
 
 		 503 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  52.25 
 
 		 496 aa  535  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  54.51 
 
 		 494 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  52.97 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  54.83 
 
 		 499 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  52.56 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  53.59 
 
 		 494 aa  530  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  55.03 
 
 		 499 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  54.18 
 
 		 494 aa  531  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  54.3 
 
 		 494 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  54.62 
 
 		 503 aa  528  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  52.76 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  53.07 
 
 		 501 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  53.69 
 
 		 501 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  53.64 
 
 		 505 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  53.59 
 
 		 503 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  53.64 
 
 		 505 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  52.76 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  53.78 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  55.92 
 
 		 501 aa  522  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  52.86 
 
 		 501 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21570  glycerol kinase  53.96 
 
 		 503 aa  524  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  53.91 
 
 		 500 aa  525  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  54 
 
 		 500 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  52.75 
 
 		 507 aa  524  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  51.74 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  52.66 
 
 		 501 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  52.58 
 
 		 503 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  52.58 
 
 		 503 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  53.18 
 
 		 505 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  53.37 
 
 		 494 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  52.58 
 
 		 518 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  52.58 
 
 		 518 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  52.58 
 
 		 518 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  52.58 
 
 		 518 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  52.58 
 
 		 518 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  53.39 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>