More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4112 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  98.79 
 
 
494 aa  1012    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  98.79 
 
 
494 aa  1010    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  98.58 
 
 
494 aa  1009    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  62.73 
 
 
502 aa  655    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  62.93 
 
 
502 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  100 
 
 
494 aa  1022    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  37.88 
 
 
502 aa  318  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  30.73 
 
 
508 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  30.27 
 
 
508 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.59 
 
 
497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0613  carbohydrate kinase, FGGY  25.96 
 
 
481 aa  141  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.116215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1584  carbohydrate kinase FGGY  28.73 
 
 
449 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  26.7 
 
 
512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  24.66 
 
 
502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  26.61 
 
 
498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  26.33 
 
 
483 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0722  carbohydrate kinase, FGGY  27.44 
 
 
491 aa  124  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285117  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  26.47 
 
 
498 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  26.67 
 
 
479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  25.32 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.22 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  23.33 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1485  glycerol kinase  26.91 
 
 
505 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00136931  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  26.74 
 
 
499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  27.25 
 
 
505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  25.71 
 
 
498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  25.71 
 
 
498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  25.05 
 
 
501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  27.55 
 
 
492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  26.14 
 
 
496 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  24.79 
 
 
500 aa  117  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0962  glycerol kinase  26.4 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  26.41 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3636  carbohydrate kinase FGGY  24.27 
 
 
503 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  26.68 
 
 
500 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  28.91 
 
 
507 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  25.49 
 
 
499 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  25.05 
 
 
505 aa  113  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3522  carbohydrate kinase FGGY  25.05 
 
 
504 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.11 
 
 
501 aa  113  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  23.98 
 
 
496 aa  113  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4817  glycerol kinase  26.45 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.274509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  25.05 
 
 
503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  25.97 
 
 
498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.99 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  25.76 
 
 
511 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  26.2 
 
 
506 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  25 
 
 
493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  25 
 
 
493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  24.89 
 
 
501 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  24.19 
 
 
505 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  22.45 
 
 
496 aa  110  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  24.69 
 
 
493 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  25.7 
 
 
493 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  24.89 
 
 
507 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  25.43 
 
 
499 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  24.89 
 
 
507 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  24.89 
 
 
507 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  24.67 
 
 
503 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  25.79 
 
 
507 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  25.05 
 
 
499 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  25.3 
 
 
493 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  24.62 
 
 
505 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  23.71 
 
 
499 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  26.98 
 
 
492 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  25 
 
 
499 aa  108  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  25.23 
 
 
503 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  25.6 
 
 
496 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  25.23 
 
 
493 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  25.6 
 
 
496 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  25.97 
 
 
492 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  25 
 
 
496 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  26.77 
 
 
492 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  25.43 
 
 
513 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  23.27 
 
 
512 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0140  glycerol kinase  25.28 
 
 
493 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0145191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  25.81 
 
 
476 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  25.81 
 
 
476 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  25.05 
 
 
502 aa  107  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  25.11 
 
 
515 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  25.6 
 
 
496 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  25.6 
 
 
496 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  25.6 
 
 
496 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  25.43 
 
 
499 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  24.29 
 
 
493 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  25.6 
 
 
496 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  24.35 
 
 
496 aa  107  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  26.1 
 
 
500 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  26.03 
 
 
500 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  24.89 
 
 
503 aa  106  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  24.4 
 
 
500 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  24.4 
 
 
500 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  24.4 
 
 
500 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  24.13 
 
 
496 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  26.36 
 
 
502 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  25.06 
 
 
493 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  22.59 
 
 
493 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2590  glycerol kinase  24.16 
 
 
483 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0112292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  25.35 
 
 
497 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  24.07 
 
 
500 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>