More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3131 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  64.56 
 
 		 502 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  64.5 
 
 		 500 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  63.93 
 
 		 519 aa  656    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  72.32 
 
 		 498 aa  752    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  63.21 
 
 		 493 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  72.73 
 
 		 498 aa  754    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  64.99 
 
 		 519 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  69.15 
 
 		 500 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  64.98 
 
 		 500 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  65.24 
 
 		 489 aa  653    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  64.78 
 
 		 529 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  69.15 
 
 		 500 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  64.17 
 
 		 500 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  65.39 
 
 		 503 aa  669    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  66.6 
 
 		 494 aa  677    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  71.52 
 
 		 500 aa  746    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  75.86 
 
 		 497 aa  768    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  66.12 
 
 		 507 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  63.75 
 
 		 495 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  63.54 
 
 		 496 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  79.19 
 
 		 497 aa  833    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  94.57 
 
 		 497 aa  968    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  100 
 
 		 497 aa  1011    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  63.21 
 
 		 493 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  62.6 
 
 		 493 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  64.44 
 
 		 501 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  58.75 
 
 		 495 aa  611  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  57.72 
 
 		 501 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  60.41 
 
 		 497 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  58.87 
 
 		 494 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  58.67 
 
 		 494 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  57.61 
 
 		 494 aa  592  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  57.06 
 
 		 493 aa  586  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  55.28 
 
 		 494 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  56.73 
 
 		 497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  55.89 
 
 		 498 aa  569  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  56.5 
 
 		 501 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.4 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  55.4 
 
 		 496 aa  570  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  54.64 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  57.61 
 
 		 497 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  54.44 
 
 		 501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  53.44 
 
 		 499 aa  558  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  55.78 
 
 		 520 aa  560  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  54.25 
 
 		 497 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  56.84 
 
 		 505 aa  560  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  53.85 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  53.85 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  52.23 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  52.63 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  56.8 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  55.85 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  56.05 
 
 		 503 aa  552  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  57.11 
 
 		 495 aa  554  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  57.72 
 
 		 499 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  52.02 
 
 		 496 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  52.23 
 
 		 496 aa  551  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  52.23 
 
 		 496 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  52.23 
 
 		 496 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  52.02 
 
 		 496 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  52.23 
 
 		 496 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  51.82 
 
 		 496 aa  548  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  56.1 
 
 		 497 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  54.03 
 
 		 494 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  51.62 
 
 		 496 aa  548  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  54.56 
 
 		 497 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  53.66 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  55.28 
 
 		 494 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  53.43 
 
 		 496 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  53.97 
 
 		 513 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  56.42 
 
 		 496 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  55.08 
 
 		 494 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  57.72 
 
 		 504 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  55.69 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  55.08 
 
 		 494 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  54.56 
 
 		 502 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  54.6 
 
 		 516 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  53.25 
 
 		 495 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  54.9 
 
 		 494 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  55.31 
 
 		 494 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  54.69 
 
 		 503 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  54.88 
 
 		 494 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  54.45 
 
 		 498 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  53.54 
 
 		 498 aa  541  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  55.71 
 
 		 496 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  55.31 
 
 		 494 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  55.1 
 
 		 494 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  56.01 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  54.88 
 
 		 497 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  55.92 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2009  glycerol kinase  56.39 
 
 		 495 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.904533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  52.87 
 
 		 500 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  53.88 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  53.55 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  53.88 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  52.87 
 
 		 500 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  56.01 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  54.9 
 
 		 494 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  53.88 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  53.88 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>