More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2231 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  68.75 
 
 		 497 aa  686    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  62.3 
 
 		 498 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  64.98 
 
 		 497 aa  665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  78.71 
 
 		 519 aa  833    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  86.55 
 
 		 500 aa  899    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  64.78 
 
 		 497 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  64.44 
 
 		 493 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  83.94 
 
 		 501 aa  846    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  74.13 
 
 		 502 aa  756    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  100 
 
 		 529 aa  1080    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  84.14 
 
 		 500 aa  880    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  83.3 
 
 		 503 aa  870    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  64.78 
 
 		 494 aa  673    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  66.4 
 
 		 497 aa  643    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  62.7 
 
 		 498 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  64.55 
 
 		 500 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  63.29 
 
 		 519 aa  645    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  63.97 
 
 		 497 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  75.76 
 
 		 507 aa  774    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  64.78 
 
 		 495 aa  661    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  64.78 
 
 		 496 aa  659    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  85.14 
 
 		 500 aa  865    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  62.83 
 
 		 493 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  62.83 
 
 		 493 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  63.06 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  62.93 
 
 		 494 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  61.66 
 
 		 500 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  62.53 
 
 		 494 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  61.63 
 
 		 495 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  61.26 
 
 		 500 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  60.94 
 
 		 501 aa  612  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  61.15 
 
 		 493 aa  609  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  56.94 
 
 		 520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  57.23 
 
 		 497 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  57.58 
 
 		 494 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  56.03 
 
 		 494 aa  566  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  60.38 
 
 		 505 aa  561  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  55.19 
 
 		 496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  54.99 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  56.71 
 
 		 499 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  54.58 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  54.49 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  54.58 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  54.58 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  56.62 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.49 
 
 		 496 aa  559  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  54.58 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  56.25 
 
 		 497 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  54.58 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  54.38 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  54.58 
 
 		 496 aa  558  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  54.38 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  56.3 
 
 		 497 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  56.88 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  56.07 
 
 		 496 aa  555  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  55.8 
 
 		 513 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  53.56 
 
 		 499 aa  550  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  56.53 
 
 		 498 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  54.18 
 
 		 498 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  54.18 
 
 		 498 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  55.69 
 
 		 497 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  55.31 
 
 		 499 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  54.25 
 
 		 501 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  53.98 
 
 		 514 aa  547  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  53.06 
 
 		 497 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  53.27 
 
 		 498 aa  545  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  54.07 
 
 		 501 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  55.71 
 
 		 498 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  55.92 
 
 		 498 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  55.01 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  55.1 
 
 		 499 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  55.6 
 
 		 498 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  54.99 
 
 		 510 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  55.22 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  56.62 
 
 		 496 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  55.19 
 
 		 498 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  54.4 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  54.49 
 
 		 501 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  56.53 
 
 		 496 aa  537  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  55.98 
 
 		 498 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  56.53 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  54.22 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2009  glycerol kinase  56.74 
 
 		 495 aa  532  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.904533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  54.33 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  54.22 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  55.02 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  57 
 
 		 501 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  54.22 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  52.01 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  52.01 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  52.01 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  52.71 
 
 		 518 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  52.71 
 
 		 518 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  55.1 
 
 		 497 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  53.68 
 
 		 503 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  52.71 
 
 		 518 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  52.01 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  54.22 
 
 		 500 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  52.01 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  52.71 
 
 		 518 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>