More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00242 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  63.21 
 
 		 494 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  61.41 
 
 		 501 aa  647    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  64.1 
 
 		 495 aa  664    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  63.82 
 
 		 494 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  100 
 
 		 494 aa  1021    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  61.91 
 
 		 493 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  64.43 
 
 		 494 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  59.23 
 
 		 497 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  59.3 
 
 		 497 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  55.71 
 
 		 501 aa  598  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  55.92 
 
 		 514 aa  600  1e-170  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  58.43 
 
 		 503 aa  598  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  58.57 
 
 		 494 aa  598  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  58.3 
 
 		 519 aa  597  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  57.61 
 
 		 497 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  59.03 
 
 		 497 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  58.62 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  56.39 
 
 		 498 aa  593  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  57.61 
 
 		 497 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  57.43 
 
 		 519 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  58.61 
 
 		 489 aa  587  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  57.17 
 
 		 507 aa  581  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  57.7 
 
 		 495 aa  579  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  57.91 
 
 		 496 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  56.44 
 
 		 496 aa  578  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  56.71 
 
 		 502 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  57.29 
 
 		 493 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  56.28 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  56.56 
 
 		 493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  56.59 
 
 		 498 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  54.88 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  54.69 
 
 		 498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  54.69 
 
 		 498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.01 
 
 		 496 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  56.19 
 
 		 498 aa  570  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  56.42 
 
 		 493 aa  571  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  55.87 
 
 		 500 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  54.67 
 
 		 500 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  55.4 
 
 		 497 aa  570  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  56.56 
 
 		 493 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  53.67 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  53.67 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  53.67 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  56.48 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  53.88 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  56.03 
 
 		 529 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  55.58 
 
 		 497 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  55.92 
 
 		 498 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  57.35 
 
 		 504 aa  567  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  53.88 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  55.47 
 
 		 507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  52.86 
 
 		 499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  53.47 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.67 
 
 		 496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  53.27 
 
 		 496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  57.4 
 
 		 497 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  55.47 
 
 		 507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  53.47 
 
 		 496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  53.47 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  55.89 
 
 		 498 aa  565  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  53.78 
 
 		 495 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  55.47 
 
 		 507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  55.08 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  55.08 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  55.08 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  55.08 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  55.87 
 
 		 500 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  54.29 
 
 		 501 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  55.08 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  55.08 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  54.67 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  55.08 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  55.08 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  55.08 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  54.67 
 
 		 502 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  54.69 
 
 		 498 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  54.67 
 
 		 502 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  56.88 
 
 		 499 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  54.67 
 
 		 502 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  54.67 
 
 		 502 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  54.47 
 
 		 513 aa  557  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  56.76 
 
 		 500 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  54.67 
 
 		 502 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  54.67 
 
 		 502 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  54.38 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  54.05 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  54.53 
 
 		 507 aa  553  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  53.97 
 
 		 494 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  54.9 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  54.49 
 
 		 496 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  54.27 
 
 		 505 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  51.94 
 
 		 502 aa  548  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  56.07 
 
 		 501 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  52.74 
 
 		 494 aa  551  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  53.78 
 
 		 495 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  53.44 
 
 		 505 aa  548  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  54.27 
 
 		 505 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  54.21 
 
 		 499 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  53.85 
 
 		 503 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  54 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>