More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1320 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  63.41 
 
 		 497 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  64.24 
 
 		 500 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  99.19 
 
 		 493 aa  990    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  63.82 
 
 		 497 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  63.21 
 
 		 497 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  69.37 
 
 		 519 aa  689    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  65.17 
 
 		 502 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  66.94 
 
 		 489 aa  659    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  62.83 
 
 		 529 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  63.43 
 
 		 500 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  64.04 
 
 		 503 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  66.8 
 
 		 494 aa  679    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  66.33 
 
 		 497 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  65.71 
 
 		 500 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  63.41 
 
 		 500 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  74.29 
 
 		 495 aa  746    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  74.49 
 
 		 496 aa  747    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  93.51 
 
 		 493 aa  941    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  66.6 
 
 		 507 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  100 
 
 		 493 aa  996    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  62.83 
 
 		 519 aa  632  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  62.6 
 
 		 500 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  62.3 
 
 		 500 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  62.83 
 
 		 501 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  63.04 
 
 		 498 aa  608  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  62.63 
 
 		 498 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  58.78 
 
 		 495 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  61.59 
 
 		 497 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  57.76 
 
 		 494 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  57.4 
 
 		 497 aa  577  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  57.96 
 
 		 494 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  56.56 
 
 		 494 aa  571  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  58.04 
 
 		 501 aa  565  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  56.15 
 
 		 496 aa  561  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  55.53 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  56.44 
 
 		 493 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  57.59 
 
 		 505 aa  555  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  57.46 
 
 		 496 aa  553  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  54.49 
 
 		 494 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  57.32 
 
 		 499 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  54.53 
 
 		 498 aa  545  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  55.28 
 
 		 499 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  55.28 
 
 		 499 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  54.81 
 
 		 497 aa  548  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  54.47 
 
 		 500 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  56.73 
 
 		 520 aa  544  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  54.67 
 
 		 503 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  54.67 
 
 		 518 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  54.67 
 
 		 503 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  54.07 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  54.88 
 
 		 500 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  54.67 
 
 		 518 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  54.27 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  54.67 
 
 		 518 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  52.86 
 
 		 497 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  54.27 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  54.27 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  54.27 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  54.75 
 
 		 496 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  54.67 
 
 		 518 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  54.67 
 
 		 518 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  54.27 
 
 		 500 aa  538  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  51.72 
 
 		 496 aa  537  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  51.84 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  53.96 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  51.21 
 
 		 496 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  54.88 
 
 		 499 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  53.96 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  54.51 
 
 		 503 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  55.8 
 
 		 501 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  53.55 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  55.08 
 
 		 497 aa  532  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  53.27 
 
 		 514 aa  531  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  53.66 
 
 		 496 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  59.1 
 
 		 504 aa  531  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  52.64 
 
 		 499 aa  531  1e-150  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  53.05 
 
 		 499 aa  534  1e-150  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  56.83 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  54.58 
 
 		 498 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  50.61 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  55.26 
 
 		 502 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  50.61 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  53.06 
 
 		 501 aa  529  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  54.18 
 
 		 513 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  50.61 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  50.61 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  53.48 
 
 		 502 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  50.61 
 
 		 496 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>