More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3533 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  100 
 
 		 497 aa  1030    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  59.96 
 
 		 502 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  59.3 
 
 		 494 aa  607  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  57.98 
 
 		 507 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  59.27 
 
 		 500 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  58.68 
 
 		 494 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  58.14 
 
 		 495 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  58.98 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  57.96 
 
 		 497 aa  594  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  57.67 
 
 		 493 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  57.64 
 
 		 503 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  58.16 
 
 		 494 aa  588  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  58.06 
 
 		 494 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.08 
 
 		 496 aa  590  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  56.94 
 
 		 494 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  57.84 
 
 		 500 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  57.32 
 
 		 501 aa  585  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.88 
 
 		 496 aa  588  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  55.62 
 
 		 498 aa  582  1.0000000000000001e-165  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  55.56 
 
 		 496 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  57.03 
 
 		 519 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  54.34 
 
 		 496 aa  579  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  55.35 
 
 		 496 aa  579  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  53.86 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  54.95 
 
 		 496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  54.95 
 
 		 496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  54.95 
 
 		 496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  54.88 
 
 		 498 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  58.86 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  57.23 
 
 		 529 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  55.35 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  55.94 
 
 		 501 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  54.88 
 
 		 498 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  54.95 
 
 		 496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  55.65 
 
 		 513 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  54.55 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  54.1 
 
 		 501 aa  575  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  54.3 
 
 		 514 aa  577  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  56.73 
 
 		 497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  55.35 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  54.75 
 
 		 496 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  55.56 
 
 		 503 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  55.56 
 
 		 518 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  55.56 
 
 		 518 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  55.56 
 
 		 503 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  54.75 
 
 		 496 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  54.94 
 
 		 499 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  56.15 
 
 		 489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  55.35 
 
 		 500 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  55.56 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  56.12 
 
 		 496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  55.56 
 
 		 518 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  55.56 
 
 		 518 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  55.56 
 
 		 518 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  56.94 
 
 		 497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  54.44 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  55.14 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  55.71 
 
 		 495 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  54.55 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  54.73 
 
 		 499 aa  568  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  54.94 
 
 		 500 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  54.94 
 
 		 500 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  54.94 
 
 		 500 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  54.47 
 
 		 497 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  54.29 
 
 		 494 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  55.51 
 
 		 494 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  57.64 
 
 		 501 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  57.29 
 
 		 499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  55.03 
 
 		 519 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  54.75 
 
 		 496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  57.14 
 
 		 500 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  54.9 
 
 		 494 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  56.94 
 
 		 500 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  55.1 
 
 		 498 aa  558  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  54.08 
 
 		 494 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  54.69 
 
 		 494 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  54.07 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  54.69 
 
 		 498 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  54.69 
 
 		 494 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  55.21 
 
 		 493 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  53.16 
 
 		 495 aa  558  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  55.25 
 
 		 505 aa  555  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  54.08 
 
 		 498 aa  558  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  54.71 
 
 		 501 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  54.69 
 
 		 494 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  51.9 
 
 		 502 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  54.56 
 
 		 510 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  52.3 
 
 		 502 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  54.95 
 
 		 496 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  51.9 
 
 		 502 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  51.9 
 
 		 502 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  53.93 
 
 		 498 aa  551  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  53.47 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  53.27 
 
 		 494 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  52.11 
 
 		 502 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  51.9 
 
 		 502 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  54.77 
 
 		 494 aa  552  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  52.31 
 
 		 502 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  53.52 
 
 		 501 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  54.53 
 
 		 496 aa  548  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>