More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5976 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  67.07 
 
 		 497 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  69.29 
 
 		 498 aa  712    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  68.75 
 
 		 497 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  69.7 
 
 		 498 aa  715    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  64.15 
 
 		 494 aa  651    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  67.88 
 
 		 500 aa  703    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  100 
 
 		 500 aa  1018    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  95.4 
 
 		 500 aa  972    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  65.16 
 
 		 495 aa  655    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  64.75 
 
 		 496 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  68.01 
 
 		 497 aa  711    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  69.15 
 
 		 497 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  61.94 
 
 		 507 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  62.6 
 
 		 493 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  62.27 
 
 		 500 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  62.4 
 
 		 493 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  61.99 
 
 		 493 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  62.8 
 
 		 489 aa  623  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  61.46 
 
 		 500 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  61.09 
 
 		 503 aa  622  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  60.61 
 
 		 502 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  61.26 
 
 		 529 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  60.94 
 
 		 519 aa  617  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  60.48 
 
 		 519 aa  610  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  62.47 
 
 		 501 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  61.46 
 
 		 500 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  57.86 
 
 		 495 aa  587  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  58.42 
 
 		 497 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  57.14 
 
 		 501 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  58.35 
 
 		 494 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  58.22 
 
 		 520 aa  580  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  58.13 
 
 		 505 aa  579  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  58.23 
 
 		 494 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  58.1 
 
 		 497 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  55.96 
 
 		 493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  57.61 
 
 		 496 aa  570  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  55.49 
 
 		 498 aa  567  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  57.87 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  55.19 
 
 		 498 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  55.19 
 
 		 498 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  55.42 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.62 
 
 		 496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  53.86 
 
 		 499 aa  559  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  55.87 
 
 		 494 aa  559  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  53.77 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  55.56 
 
 		 498 aa  558  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  57.14 
 
 		 497 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  53.36 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.36 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  53.36 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  57.35 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  53.86 
 
 		 497 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  53.36 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  53.16 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  53.16 
 
 		 496 aa  552  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  53.16 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  53.56 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  53.16 
 
 		 496 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  55.49 
 
 		 496 aa  555  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  53.77 
 
 		 513 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  54.49 
 
 		 501 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  58.82 
 
 		 504 aa  548  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  54.47 
 
 		 495 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  53.27 
 
 		 507 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  54.23 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  53.27 
 
 		 507 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  54.58 
 
 		 496 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  54.47 
 
 		 497 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  53.27 
 
 		 507 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  52.64 
 
 		 495 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  54 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  54.19 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  52.54 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  53.69 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  55.28 
 
 		 505 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  53.31 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  53.37 
 
 		 510 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  53.25 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  52.54 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  53.11 
 
 		 501 aa  535  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  52.54 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  52.54 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  52.33 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  52.54 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  53.86 
 
 		 497 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  51.72 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  51.72 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  53.59 
 
 		 503 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  51.94 
 
 		 501 aa  533  1e-150  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  53.18 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  53.18 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  51.72 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  53.17 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  52.45 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  53.99 
 
 		 499 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  53.58 
 
 		 499 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  53.05 
 
 		 494 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  53.59 
 
 		 518 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  53.59 
 
 		 518 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  53.59 
 
 		 518 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>