More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3683 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  66.53 
 
 
507 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  67.21 
 
 
497 aa  681    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  63.13 
 
 
500 aa  638    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  66.74 
 
 
493 aa  658    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  68.17 
 
 
493 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  100 
 
 
489 aa  992    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  62.53 
 
 
500 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  62.45 
 
 
503 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  65.85 
 
 
497 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  69.88 
 
 
494 aa  696    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  65.78 
 
 
500 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  64.27 
 
 
502 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  66.46 
 
 
519 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  65.24 
 
 
497 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  67.68 
 
 
495 aa  672    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  67.14 
 
 
496 aa  673    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  66.94 
 
 
493 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  62.53 
 
 
519 aa  631  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  65.78 
 
 
497 aa  634  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  63.06 
 
 
529 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  63.34 
 
 
498 aa  626  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  62.93 
 
 
498 aa  623  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  63.01 
 
 
500 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  62.8 
 
 
500 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  61.84 
 
 
500 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  61.32 
 
 
501 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  61.02 
 
 
494 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  60.61 
 
 
494 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  59.18 
 
 
495 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  58.61 
 
 
501 aa  594  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  58.61 
 
 
494 aa  587  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  61.11 
 
 
497 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  59.27 
 
 
497 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  56.15 
 
 
497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  56.44 
 
 
493 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  57.49 
 
 
494 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  54.81 
 
 
497 aa  551  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  56.59 
 
 
520 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  52.05 
 
 
499 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2009  glycerol kinase  56.8 
 
 
495 aa  545  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.904533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  52.87 
 
 
496 aa  545  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  53.07 
 
 
496 aa  542  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  52.46 
 
 
498 aa  544  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  52.46 
 
 
498 aa  544  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  57.35 
 
 
499 aa  542  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  53.67 
 
 
514 aa  539  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  52.87 
 
 
496 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  53.07 
 
 
496 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.07 
 
 
496 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  52.75 
 
 
496 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  52.75 
 
 
496 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  53.07 
 
 
496 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  53.07 
 
 
496 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  52.87 
 
 
496 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  55.8 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  53.07 
 
 
496 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  53.78 
 
 
500 aa  540  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  53.47 
 
 
501 aa  537  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  54.73 
 
 
498 aa  536  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  54.19 
 
 
501 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  51.63 
 
 
496 aa  534  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  55.17 
 
 
496 aa  533  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  53.92 
 
 
498 aa  529  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  53.67 
 
 
494 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  53.93 
 
 
498 aa  528  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  53.59 
 
 
507 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  53.59 
 
 
507 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  53.59 
 
 
507 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  53.67 
 
 
498 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  54.69 
 
 
496 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  55.6 
 
 
501 aa  524  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  53.27 
 
 
496 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  52.76 
 
 
498 aa  521  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  54.27 
 
 
499 aa  524  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  54.6 
 
 
496 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  51.54 
 
 
497 aa  519  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  52.36 
 
 
502 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  53.31 
 
 
513 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  53.37 
 
 
499 aa  521  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  53.27 
 
 
498 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  56.33 
 
 
504 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  53.24 
 
 
503 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  53.18 
 
 
503 aa  518  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  54.6 
 
 
505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  52.04 
 
 
502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  50.61 
 
 
502 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  52.04 
 
 
502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  51.23 
 
 
489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  52.02 
 
 
502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  52.98 
 
 
493 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  52.35 
 
 
499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  52.04 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  52.04 
 
 
502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  53.61 
 
 
496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  52.04 
 
 
502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  52.04 
 
 
502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  52.48 
 
 
518 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  51.84 
 
 
502 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  50.92 
 
 
495 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  53.09 
 
 
510 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>