More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3316 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  68.89 
 
 		 498 aa  707    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  76.46 
 
 		 497 aa  792    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  75.6 
 
 		 497 aa  793    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  64.97 
 
 		 502 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  66.12 
 
 		 493 aa  652    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  66.73 
 
 		 493 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  67.62 
 
 		 507 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  75.86 
 
 		 497 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  65.78 
 
 		 489 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  66.4 
 
 		 529 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  66.46 
 
 		 500 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  64.57 
 
 		 500 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  64.59 
 
 		 503 aa  648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  65.79 
 
 		 500 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  63.34 
 
 		 494 aa  642    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  69.96 
 
 		 500 aa  721    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  100 
 
 		 497 aa  1002    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  64.69 
 
 		 495 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  64.29 
 
 		 496 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  69.29 
 
 		 498 aa  710    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  67.07 
 
 		 500 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  65.71 
 
 		 519 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  67.07 
 
 		 500 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  66.33 
 
 		 493 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  63.18 
 
 		 519 aa  633  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  65.38 
 
 		 501 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  59.03 
 
 		 494 aa  606  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  60.98 
 
 		 494 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  60.77 
 
 		 494 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  62.45 
 
 		 497 aa  598  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  59.15 
 
 		 495 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  58.94 
 
 		 501 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  58.99 
 
 		 494 aa  595  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  58.94 
 
 		 493 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  57.11 
 
 		 498 aa  579  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  58.62 
 
 		 497 aa  578  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  54.66 
 
 		 497 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  55.26 
 
 		 498 aa  565  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  55.26 
 
 		 498 aa  565  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  54.66 
 
 		 499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  56.19 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  54.45 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  56.01 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  54.45 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  54.45 
 
 		 496 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  57.77 
 
 		 505 aa  560  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  54.45 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  54.25 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  54.45 
 
 		 496 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  54.05 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  53.85 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  54.25 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  55.89 
 
 		 501 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  54.84 
 
 		 514 aa  556  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  55.51 
 
 		 497 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  54.64 
 
 		 501 aa  555  1e-157  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  55.94 
 
 		 513 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  57.14 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  59.02 
 
 		 504 aa  548  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  58.13 
 
 		 501 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  56.59 
 
 		 495 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  57.76 
 
 		 496 aa  548  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  57.76 
 
 		 496 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  54.34 
 
 		 498 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  56.73 
 
 		 494 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  55.08 
 
 		 495 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  56.73 
 
 		 494 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  56.53 
 
 		 494 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  56.53 
 
 		 494 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  56.73 
 
 		 494 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  56.12 
 
 		 494 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  56.1 
 
 		 494 aa  542  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  56.71 
 
 		 496 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  54.08 
 
 		 502 aa  541  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  55.31 
 
 		 520 aa  541  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  56.33 
 
 		 494 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  53.04 
 
 		 496 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  53.86 
 
 		 502 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  52.85 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  53.54 
 
 		 500 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  53.13 
 
 		 500 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  56.33 
 
 		 496 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  54.9 
 
 		 493 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  54.08 
 
 		 503 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  52.64 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  52.64 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  52.64 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  52.85 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  52.85 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  52.77 
 
 		 501 aa  537  1e-151  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  52.85 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  52.64 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  53.67 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2009  glycerol kinase  58.57 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.904533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  53.67 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  52.64 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  52.85 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  52.64 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  54.77 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  52.64 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>