More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4826 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  62.93 
 
 
494 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  62.93 
 
 
494 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  62.93 
 
 
494 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  97.81 
 
 
502 aa  1015    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  62.93 
 
 
494 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  100 
 
 
502 aa  1040    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  34.13 
 
 
502 aa  293  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  31.78 
 
 
508 aa  170  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0613  carbohydrate kinase, FGGY  26.02 
 
 
481 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.116215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  29.74 
 
 
508 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1584  carbohydrate kinase FGGY  26.68 
 
 
449 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.21 
 
 
497 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  29.68 
 
 
512 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  26.2 
 
 
519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.3 
 
 
530 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.09 
 
 
514 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  23.58 
 
 
496 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  24.84 
 
 
512 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  28.25 
 
 
508 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0722  carbohydrate kinase, FGGY  28.2 
 
 
491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285117  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  26.59 
 
 
483 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  28.23 
 
 
494 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  23.57 
 
 
501 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0962  glycerol kinase  25.93 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  26.57 
 
 
504 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  26.35 
 
 
498 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  27.49 
 
 
494 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  24.36 
 
 
500 aa  113  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.25 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  22.84 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  27.91 
 
 
495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  24.28 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  24.18 
 
 
493 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  23.42 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  26.81 
 
 
513 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  27.13 
 
 
496 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.66 
 
 
499 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  25.4 
 
 
488 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  24.08 
 
 
503 aa  109  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  25.4 
 
 
488 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25.9 
 
 
538 aa  109  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  22.97 
 
 
512 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  27.53 
 
 
500 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  27.73 
 
 
497 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  21.19 
 
 
505 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0140  glycerol kinase  27.52 
 
 
493 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0145191  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  23.49 
 
 
499 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1515  glycerol kinase  27.63 
 
 
484 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  23.78 
 
 
479 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  26.77 
 
 
491 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  22.75 
 
 
511 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  22.75 
 
 
512 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.21 
 
 
548 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  26.3 
 
 
472 aa  107  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  26.3 
 
 
472 aa  107  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1325  glycerol kinase  28.98 
 
 
484 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.597803  normal  0.0494586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  26.3 
 
 
482 aa  107  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  28.61 
 
 
506 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  26.08 
 
 
488 aa  107  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  27.08 
 
 
492 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  26.3 
 
 
482 aa  107  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  22.54 
 
 
496 aa  106  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  22.52 
 
 
512 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  25 
 
 
486 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4817  glycerol kinase  23.68 
 
 
500 aa  106  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.274509 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1485  glycerol kinase  25.49 
 
 
505 aa  106  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00136931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  26.3 
 
 
472 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  23.31 
 
 
496 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  26.3 
 
 
472 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  24.75 
 
 
512 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  25.16 
 
 
502 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  25.76 
 
 
472 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.4 
 
 
509 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  24.94 
 
 
488 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  26.09 
 
 
482 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  23.37 
 
 
515 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  27.61 
 
 
498 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  26.14 
 
 
501 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2590  glycerol kinase  26.89 
 
 
483 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0112292  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  25.22 
 
 
511 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  23.47 
 
 
486 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  25.91 
 
 
487 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  25.07 
 
 
505 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  23.39 
 
 
502 aa  103  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  24.46 
 
 
501 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  27.18 
 
 
497 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  26.17 
 
 
510 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  21.16 
 
 
492 aa  103  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  21.16 
 
 
492 aa  103  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  25.6 
 
 
490 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  25.6 
 
 
490 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  25.6 
 
 
490 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  22.55 
 
 
502 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  25.6 
 
 
490 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  23.82 
 
 
475 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  26.35 
 
 
500 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  25.61 
 
 
493 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  23.82 
 
 
475 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.54 
 
 
509 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  23.82 
 
 
475 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>