More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0876 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  63.27 
 
 		 496 aa  652    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  63.67 
 
 		 496 aa  654    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  62.75 
 
 		 520 aa  641    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  100 
 
 		 497 aa  995    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  63.49 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  60.28 
 
 		 498 aa  626  1e-178  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  61.49 
 
 		 497 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  59.48 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  60.28 
 
 		 497 aa  618  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  62.3 
 
 		 505 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  60.56 
 
 		 497 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  59.27 
 
 		 501 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  61.82 
 
 		 501 aa  610  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  61.91 
 
 		 505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  57.17 
 
 		 496 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  61.18 
 
 		 496 aa  601  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  57.17 
 
 		 496 aa  598  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  57.17 
 
 		 496 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  57.17 
 
 		 496 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  58.82 
 
 		 507 aa  598  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  58.2 
 
 		 494 aa  598  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  58.54 
 
 		 489 aa  598  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  57.17 
 
 		 496 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  59.63 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  59.63 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  59.96 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  59.47 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  59.43 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  56.97 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  57.17 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  56.97 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  59.63 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  59.43 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  59.43 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  59.63 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  56.57 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  59.63 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  59.63 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  59.43 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  59.43 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  59.63 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  59.63 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  56.07 
 
 		 494 aa  594  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  58.66 
 
 		 503 aa  594  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  58.22 
 
 		 502 aa  591  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  58.33 
 
 		 505 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  61.22 
 
 		 496 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  59.43 
 
 		 505 aa  591  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  60.04 
 
 		 498 aa  594  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  59.15 
 
 		 498 aa  594  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  59.23 
 
 		 504 aa  593  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  59.27 
 
 		 505 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  59.67 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  58.78 
 
 		 499 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  60.4 
 
 		 496 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  57.66 
 
 		 500 aa  588  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  58.69 
 
 		 494 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  58.3 
 
 		 513 aa  584  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  59.39 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  59.43 
 
 		 497 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  57.78 
 
 		 501 aa  587  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  58.37 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  58.01 
 
 		 502 aa  585  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  56.42 
 
 		 494 aa  586  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  57.26 
 
 		 500 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  58.69 
 
 		 494 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  58.69 
 
 		 494 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  59.63 
 
 		 498 aa  585  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  59.23 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  56.36 
 
 		 496 aa  587  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  58.16 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  58.04 
 
 		 503 aa  585  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  57.52 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  57.52 
 
 		 503 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  57.64 
 
 		 503 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  57.52 
 
 		 503 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  57.52 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  57.52 
 
 		 500 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  57.81 
 
 		 507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  58.45 
 
 		 503 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  57.52 
 
 		 518 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  58.78 
 
 		 510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  57.52 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  57.81 
 
 		 507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  57.81 
 
 		 507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  57.96 
 
 		 501 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  57.52 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  58.73 
 
 		 495 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  58.99 
 
 		 496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  57.96 
 
 		 499 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  57.52 
 
 		 518 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  59.27 
 
 		 507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  57.52 
 
 		 518 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  57.52 
 
 		 518 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  57.52 
 
 		 518 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  58.2 
 
 		 494 aa  578  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  57.76 
 
 		 501 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  57.11 
 
 		 500 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  57.97 
 
 		 495 aa  579  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  57.32 
 
 		 500 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>