More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0340 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  65.69 
 
 		 514 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  67.25 
 
 		 514 aa  698    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  66.21 
 
 		 513 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  66.21 
 
 		 513 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  67.64 
 
 		 515 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  67.19 
 
 		 515 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  66.08 
 
 		 514 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  67.06 
 
 		 520 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  66.8 
 
 		 515 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  66.8 
 
 		 515 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  67.84 
 
 		 515 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  66.8 
 
 		 515 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  66.21 
 
 		 513 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  66.21 
 
 		 513 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  66.21 
 
 		 513 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  100 
 
 		 508 aa  1033    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  66.21 
 
 		 513 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  66.21 
 
 		 513 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  57.56 
 
 		 512 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  48.13 
 
 		 511 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  45.35 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  46.14 
 
 		 506 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  45.85 
 
 		 512 aa  480  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  46.34 
 
 		 506 aa  481  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  38.6 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  36.38 
 
 		 512 aa  295  9e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  34.82 
 
 		 510 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  35.36 
 
 		 518 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  38.46 
 
 		 504 aa  286  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  38.05 
 
 		 548 aa  286  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  32.74 
 
 		 503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  33.33 
 
 		 500 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  37.13 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  33.92 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  33 
 
 		 502 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  32.75 
 
 		 509 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  34.77 
 
 		 505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  35.38 
 
 		 515 aa  266  7e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  33.47 
 
 		 530 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  34.24 
 
 		 498 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  32.16 
 
 		 509 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  30.93 
 
 		 500 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  34.38 
 
 		 511 aa  259  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  34.06 
 
 		 495 aa  259  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  30.53 
 
 		 506 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  34.43 
 
 		 493 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  35.7 
 
 		 511 aa  256  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  32.75 
 
 		 499 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  34.24 
 
 		 493 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  34.24 
 
 		 493 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  37.45 
 
 		 505 aa  252  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  32.8 
 
 		 514 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.17 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  31.54 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.49 
 
 		 496 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  31.21 
 
 		 497 aa  247  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.76 
 
 		 498 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  30.66 
 
 		 513 aa  244  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  32.14 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  31.94 
 
 		 512 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.86 
 
 		 501 aa  243  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  31.94 
 
 		 511 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  33.94 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  32 
 
 		 512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  35.05 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  30.69 
 
 		 513 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  30.69 
 
 		 513 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  30.69 
 
 		 513 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  30.5 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  30.3 
 
 		 513 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  30.69 
 
 		 513 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  32.47 
 
 		 538 aa  238  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  30.06 
 
 		 512 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  30.3 
 
 		 513 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  30.69 
 
 		 513 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  30.3 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  33.85 
 
 		 511 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  32.75 
 
 		 506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  34.04 
 
 		 517 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  34.04 
 
 		 517 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  28.82 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  31.67 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  28.82 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  30.92 
 
 		 503 aa  226  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  33.01 
 
 		 495 aa  226  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.18 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.18 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  34.9 
 
 		 499 aa  224  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  34.1 
 
 		 498 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  32.29 
 
 		 493 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  27.76 
 
 		 511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  31.5 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  27.56 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  27.36 
 
 		 511 aa  220  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  27.56 
 
 		 511 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  32.87 
 
 		 487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  33.14 
 
 		 501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  33.2 
 
 		 501 aa  216  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  32.48 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.23 
 
 		 489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>