More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1006 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 503 aa  1044    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  36.13 
 
 		 509 aa  343  5e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  37.25 
 
 		 509 aa  342  7e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  36.09 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  36.17 
 
 		 518 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  36.24 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  35.34 
 
 		 515 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  34.71 
 
 		 512 aa  324  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.61 
 
 		 512 aa  323  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  36.54 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.27 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  34.39 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  34.46 
 
 		 496 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  34.79 
 
 		 511 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  33.07 
 
 		 497 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  36.74 
 
 		 506 aa  309  9e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  34.2 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  32.93 
 
 		 548 aa  303  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.66 
 
 		 504 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.67 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  32.6 
 
 		 514 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.93 
 
 		 511 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  32.45 
 
 		 538 aa  290  4e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.81 
 
 		 506 aa  286  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  32.75 
 
 		 514 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  30.94 
 
 		 530 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  32.01 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  30.32 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  31.27 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  31.47 
 
 		 513 aa  277  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  31.47 
 
 		 513 aa  276  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  31.47 
 
 		 513 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  31.47 
 
 		 513 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  31.47 
 
 		 513 aa  276  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  31.27 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.14 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  31.47 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.14 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  31.62 
 
 		 513 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  31.51 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.1 
 
 		 510 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  31.82 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  32.74 
 
 		 508 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.34 
 
 		 499 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  30.42 
 
 		 498 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  31.83 
 
 		 514 aa  266  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  31.14 
 
 		 489 aa  266  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  31.31 
 
 		 511 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  31.31 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  31.31 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  31.46 
 
 		 512 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  31.66 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  29.9 
 
 		 505 aa  261  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  31.34 
 
 		 512 aa  260  5.0000000000000005e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  32.42 
 
 		 515 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  32.42 
 
 		 515 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  32.42 
 
 		 515 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  29.41 
 
 		 524 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  30.66 
 
 		 496 aa  258  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  31.52 
 
 		 513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  31.52 
 
 		 513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  31.52 
 
 		 513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  31.13 
 
 		 512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  31.52 
 
 		 513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  31.52 
 
 		 513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  31.52 
 
 		 513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  32.62 
 
 		 515 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  29.14 
 
 		 518 aa  254  4.0000000000000004e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  31.52 
 
 		 513 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.66 
 
 		 499 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  32.42 
 
 		 515 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  31.25 
 
 		 515 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  31.25 
 
 		 505 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  31.62 
 
 		 498 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  29.47 
 
 		 505 aa  248  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  31.01 
 
 		 495 aa  246  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  31.25 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  29.5 
 
 		 503 aa  244  3e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  29.23 
 
 		 499 aa  244  3e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  31.51 
 
 		 517 aa  244  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  31.51 
 
 		 517 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  31.91 
 
 		 514 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  31.88 
 
 		 511 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  28.63 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  29.78 
 
 		 519 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  28.97 
 
 		 519 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  31.29 
 
 		 506 aa  240  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  30.34 
 
 		 487 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  29.13 
 
 		 509 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  27.59 
 
 		 513 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.23 
 
 		 497 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  28.4 
 
 		 517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  30.72 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  29.47 
 
 		 505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  31.24 
 
 		 519 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  28.4 
 
 		 517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  28.89 
 
 		 509 aa  234  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.41 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  28.83 
 
 		 501 aa  230  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  29.22 
 
 		 499 aa  229  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>