More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4816 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  77.24 
 
 
513 aa  750    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  77.24 
 
 
513 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  95.15 
 
 
515 aa  951    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  77.5 
 
 
514 aa  820    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  77.82 
 
 
514 aa  746    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  93.98 
 
 
515 aa  919    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  100 
 
 
515 aa  1036    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  77.24 
 
 
513 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  94.17 
 
 
515 aa  919    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  79.57 
 
 
514 aa  851    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  100 
 
 
515 aa  1036    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  77.24 
 
 
513 aa  750    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  88.35 
 
 
520 aa  868    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  77.24 
 
 
513 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  66.8 
 
 
508 aa  667    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  77.43 
 
 
513 aa  751    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  77.24 
 
 
513 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  100 
 
 
515 aa  1036    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  59.88 
 
 
512 aa  633  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  50.88 
 
 
511 aa  557  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  46.27 
 
 
506 aa  505  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  46.37 
 
 
506 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  46.47 
 
 
512 aa  496  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  45.97 
 
 
506 aa  488  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  37.16 
 
 
509 aa  297  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  35.52 
 
 
518 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  34.1 
 
 
500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  34.68 
 
 
510 aa  280  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  37.7 
 
 
548 aa  279  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  32.42 
 
 
503 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  33.27 
 
 
501 aa  276  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  33.73 
 
 
502 aa  274  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  37.31 
 
 
498 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  33.46 
 
 
509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  38.34 
 
 
504 aa  267  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  37.52 
 
 
511 aa  266  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  36.47 
 
 
512 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  31.4 
 
 
506 aa  264  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  33.4 
 
 
505 aa  259  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  36.7 
 
 
506 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  33.14 
 
 
509 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  34.69 
 
 
495 aa  254  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  34.43 
 
 
498 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  32.87 
 
 
514 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.27 
 
 
496 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.77 
 
 
501 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.01 
 
 
500 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  32.21 
 
 
512 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  32.09 
 
 
530 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  32.09 
 
 
509 aa  238  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.57 
 
 
499 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  35.02 
 
 
498 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.65 
 
 
492 aa  237  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.65 
 
 
492 aa  237  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  32.15 
 
 
518 aa  236  6e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  30.46 
 
 
497 aa  236  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  32.95 
 
 
499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  30.83 
 
 
513 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  33.33 
 
 
493 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  31.62 
 
 
512 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  31.62 
 
 
511 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  30.83 
 
 
513 aa  232  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  31.56 
 
 
512 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  33.14 
 
 
493 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  33.14 
 
 
493 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  33.14 
 
 
505 aa  230  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  30.83 
 
 
513 aa  229  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  33.92 
 
 
519 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.6 
 
 
515 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  30.83 
 
 
513 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  30.83 
 
 
513 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  30.83 
 
 
513 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.81 
 
 
489 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  31.61 
 
 
512 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  31.62 
 
 
512 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  30.63 
 
 
513 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  30.83 
 
 
513 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  29.48 
 
 
512 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.77 
 
 
511 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  28.74 
 
 
513 aa  224  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  36.8 
 
 
499 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  36.4 
 
 
505 aa  219  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  30.1 
 
 
503 aa  219  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  33.53 
 
 
524 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  31.52 
 
 
489 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  29.84 
 
 
517 aa  217  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  29.84 
 
 
517 aa  217  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  32.47 
 
 
512 aa  216  9e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  32.46 
 
 
517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  34.12 
 
 
487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  32.62 
 
 
506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  29.65 
 
 
490 aa  214  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  31.57 
 
 
538 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.83 
 
 
511 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  30.46 
 
 
512 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  32.46 
 
 
517 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.38 
 
 
488 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  32.28 
 
 
489 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  30.6 
 
 
509 aa  209  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  27.36 
 
 
511 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>